Anhand der Daten.Tisch-Paket in mein Angebot

Ich versuche die Daten nutzen zu können.Tisch-Paket in mein Angebot. MWE ist wie folgt:

Ich eine Funktion erstellen, zu testen.viel Spaß, das schafft einfach eine kleine Daten.Tabelle-Objekt, und klicken Sie dann Summen die "Val" - Spalte gruppieren, indem Sie die "A" - Spalte. Der code ist

test.fun<-function ()
{
    library(data.table)
    testdata<-data.table(A=rep(seq(1,5), 5), Val=rnorm(25))
    setkey(testdata, A)
    res<-testdata[,{list(Ct=length(Val),Total=sum(Val),Avg=mean(Val))},"A"]
    return(res)
}

Wenn ich diese Funktion regelmäßig in einer R-Sitzung, und führen Sie dann die Funktion, funktioniert es wie erwartet.

> res<-test.fun()
data.table 1.8.0  For help type: help("data.table")
> res
     A Ct      Total        Avg
[1,] 1  5 -0.5326444 -0.1065289
[2,] 2  5 -4.0832062 -0.8166412
[3,] 3  5  0.9458251  0.1891650
[4,] 4  5  2.0474791  0.4094958
[5,] 5  5  2.3609443  0.4721889

Wenn ich diese Funktion in ein Paket, das Paket installieren, laden Sie das Paket, und dann die Funktion auszuführen, bekomme ich eine Fehlermeldung.

> library(testpackage)
> res<-test.fun()
data.table 1.8.0  For help type: help("data.table")
Error in `[.data.frame`(x, i, j) : object 'Val' not found

Kann jemand mir erklären, warum dies geschieht und was kann ich tun, um es zu beheben. Jede Hilfe wird sehr geschätzt.

  • Meine Vermutung ist, dass Sie noch nicht deklariert eine Abhängigkeit. Sie sollten zu entfernen library(data.table) Ihre Funktion, und erklären depends:data.table im namespace und BESCHREIBUNG.
InformationsquelleAutor ruser | 2012-05-10
  1. 87

    Andrie Vermutung richtig ist, +1. Gibt es eine FAQ (siehe vignette("datatable-faq")), sowie eine neue vignette auf importieren data.table:

    FAQ 6.9: ich habe ein Paket, das hängt von Daten ab.Tabelle. Wie kann ich
    sicher, mein Paket ist Daten.Tisch-bewusst so, dass die Vererbung von
    Daten.Rahmen funktioniert?

    Entweder i) gehören data.table im Depends: Feld BESCHREIBUNG Datei, oder ii) data.table im Imports: Feld BESCHREIBUNG Datei UND import(data.table) in Ihrem NAMENSRAUM Datei.

    Weiteren hintergrund ... an der Spitze der [.data.table (und andere data.table Funktionen), werden Sie sehen einen Schalter, je nach dem Ergebnis eines Aufrufs cedta(). Dieser steht für die Aufrufende Umgebung Daten Tabelle Bewusst. Eingabe data.table:::cedta zeigt, wie es gemacht wird. Es stützt sich auf das aufrufende Paket mit einem namespace, namespace Importieren 'Ing oder von' Ing auf data.table. Dies ist, wie data.table übergeben werden kann, um nicht-Daten.Tisch-bewusst - Pakete (wie Funktionen in base) und die Pakete können absolut standard [.data.frame syntax auf die data.table, selig nicht bewusst, dass die data.frame is() eine data.table auch.

    Dies ist auch der Grund, warum data.table Vererbung nicht verwendet werden kompatibel mit namespaceless Pakete, und warum auf Anforderung des Anwenders mussten wir Fragen Autoren solcher Pakete auf einen namespace hinzuzufügen, um Ihre Paket kompatibel sein. Glücklich, dass nun R fügt ein Standard-namespace für Pakete fehlen (von v2.14.0), das problem ist Weg :

    VERÄNDERUNGEN IN DER R-VERSION 2.14.0

    * Alle Pakete müssen einen namespace, und erstellt bei der installation nicht angegeben in der Quelle.

    • (Sorry, wieder zu beleben, aber...) Matthäus, können Sie klären, wie diese arbeiten würden von einer interaktiven Sicht? Wenn mein Paket gibt eine data.table zu einem Nutzer in einer interaktiven Sitzung, werden Sie erforderlich, um die data.table Semantik, oder gibt es eine Möglichkeit, ich könnte die Unterstützung der vertrauten data.frame syntax?
    • Das ist ein neues...sicher nicht. Wenn Ihr Paket Hängt von Daten ab.Tisch, dann machen die user Daten.Tabelle bewusst, denke ich. Vielleicht Importieren von Daten.Tabelle wäre nicht (und vielleicht ist das, was Sie möchte).
    • Vielen Dank Matt! Dies löste mein problem nach einem halben Tag von Fehlern und die Suche im Netz. Ich hatte Daten.Tabelle nur in der Einfuhr. Der code funktionierte gut in R, aber nicht von innerhalb des Pakets. Verschoben Abhängig zu machen und es funktioniert!
    • Gerne Hängt, funktioniert aber Importieren sollte funktionieren, solange Sie hatte beide Importiert in DESCRIPTION und import(data.table) im NAMESPACE als auch?
    • Du hast Recht. Ich bekam einen HINWEIS bei der Verwendung Abhängt. Ich änderte zurück zu Einfuhren + Hinzugefügt @import data.table im code so Roxygen fügt import(data.table) im NAMESPACE.
    • Ich hatte ein problem mit genau den gleichen Symptomen, aber das obige nicht funktioniert. Aus welchem Grund auch immer, @import dtplyr Tat helfen. Wäre daran interessiert zu wissen, warum.
    • Haben Sie zu erraten, ich denke, es ist die roxygen2 zusätzliche Schicht (@import) nicht ganz übersetzen, um genau den oben. Haben Sie einen Blick auf roxygen2's-Ausgabe, um zu sehen, ob es produziert hat genau über.

    InformationsquelleAutor Matt Dowle
  2. 24

    Hier ist das komplette Rezept:

    1.) data.table zu Imports in Ihrem DESCRIPTION - Datei.

    2) Fügen Sie @import data.table auf Ihre jeweiligen .R-Datei (D. H., die .R-Datei, die Häuser Ihrer Funktion, die wirft den Fehler Error in [.data.frame(x, i, j) : object 'Val' not found).

    3) Typ library(devtools) und stellen Sie Ihr Arbeitsverzeichnis auf das Haupt-Verzeichnis Ihres R-Paket.

    4) Typ document(). Dadurch wird sichergestellt, dass Ihr NAMESPACE - Datei enthält eine import(data.table) Linie.

    5) Typ build()

    6) Geben Sie install()

    Für eine schöne Grundierung auf, was build() und install() tun, siehe: http://kbroman.org/pkg_primer/.

    Dann, wenn Sie schließen Sie Ihre R-Sitzung und login das nächste mal, können Sie sofort rechts in springen mit:

    1) Typ library("my_R_package")

    2) Geben Sie den Namen der Funktion, die in einem Gehäuse untergebracht .R oben erwähnte Datei.

    3) Genießen! Sollten Sie nicht mehr die gefürchteten Error in [.data.frame(x, i, j) : object 'Val' not found

    • die @import data.table Befehl ist besonders hilfreich,
    • Ich folgte diesen Anweisungen und ich immer function not found. Ich konnte nicht finden, etwas ähnliches so habe ich eine Frage stackoverflow.com/questions/56720520/...
    InformationsquelleAutor warship
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