Fehler bei der Installation der RMySQL (MySQL 5.5.37 in Ubuntu 14.04 )
Jedes mal, wenn ich versuche die Installation RMySQL bekomme ich die folgende Fehlermeldung:
Installing package into ‘/home/ehsan/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0’
(as ‘lib’ is unspecified)
* installing *source* package ‘RMySQL’ ...
** package ‘RMySQL’ successfully unpacked and MD5 sums checked
checking for gcc... gcc
checking for C compiler default output file name... a.out
checking whether the C compiler works... yes
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of executables...
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc accepts -g... yes
checking for gcc option to accept ANSI C... none needed
checking how to run the C preprocessor... gcc -E
checking for compress in -lz... yes
checking for getopt_long in -lc... yes
checking for mysql_init in -lmysqlclient... yes
checking for egrep... grep -E
checking for ANSI C header files... yes
checking for sys/types.h... yes
checking for sys/stat.h... yes
checking for stdlib.h... yes
checking for string.h... yes
checking for memory.h... yes
checking for strings.h... yes
checking for inttypes.h... yes
checking for stdint.h... yes
checking for unistd.h... yes
checking mysql.h usability... no
checking mysql.h presence... no
checking for mysql.h... no
configure: creating ./config.status
config.status: creating src/Makevars
** libs
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I/usr/include/mysql/mysql.h -fpic -O3 -pipe -g -c RS-DBI.c -o RS-DBI.o
cc1: warning: /usr/include/mysql/mysql.h: not a directory [enabled by default]
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I/usr/include/mysql/mysql.h -fpic -O3 -pipe -g -c RS-MySQL.c -o RS-MySQL.o
cc1: warning: /usr/include/mysql/mysql.h: not a directory [enabled by default]
In file included from RS-MySQL.c:22:0:
RS-MySQL.h:32:19: fatal error: mysql.h: No such file or directory
#include <mysql.h>
^
compilation terminated.
make: *** [RS-MySQL.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘RMySQL’
* removing ‘/home/ehsan/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/RMySQL’
The downloaded source packages are in
‘/tmp/RtmpTRRPqg/downloaded_packages’
Warning message:
In install.packages("RMySQL") :
installation of package ‘RMySQL’ had non-zero exit status**
Scheinbar, kann es nicht finden, mysql.h und ich suchte und den Pfad geändert, um
export PKG_CPPFLAGS="-I/usr/R/include/mysql/mysql.h"
aber es war nicht erfolgreich. Es gibt viele Menschen, die haben hatte das gleiche Problem, aber nicht deren Lösungen (falls vorhanden) für mich gearbeitet. Ich würde schätzen jeden Kommentar und Hilfe.
#Update: Problem Gelöst#
Den folgenden Befehl schien, um das Problem zu lösen:
sudo apt-get install r-cran-rmysql
- Sie schreiben, könnte Ihre eigene Antwort statt Bearbeiten ein "Problem gelöst"
- Ich bevorzuge den mehr kompakten!
- Okay. Aber ich sage nur, dass die Menschen manchmal wird upvote Ihre Antwort, auch wenn Sie die Antwort auf Ihre eigene Frage.
Du musst angemeldet sein, um einen Kommentar abzugeben.
Wie gesagt, der folgende Befehl funktionierte für mich:
Meine dieses Problem wurde gelöst, indem Sie den folgenden Befehl ausführen:
da @ehsanmo noch nicht geschrieben, seine Antwort als Antwort, dann werde ich, und bestätigen, dass seine Lösung funktioniert bei mir auch:
(Ich bin auf mint 12)
Gut, es gibt zwei Arten installieren/machen Probleme. Fehlt .h-Dateien und/oder fehlt .so/.libs. Wie Sie sehen können aus Ihrem log, Sie fehlende .h
Der Grund für diese sind mehrere:
1.- das Paket liefert, dass diese nicht installiert ist. Dies bedeutet, dass diese Dateien nicht gefunden werden überall in den /usr-Baum. Die Lösung ist die richtige Paket installieren, stellen Sie sicher, dass die Dateien dort
2.- Die includes werden nicht gefunden, indem Sie die installieren-Konfigurator. Dies bedeutet, dass einige Umgebungsvariablen installieren, oder die option ist nicht richtig eingestellt. Die variable set ist in der Regel angegeben in die Dokumentationen; in einigen Fällen zu installieren, müssen Sie etwas außerhalb von R und wieder, das ist in der Regel angegeben in der Dokumentation.
3.- die libs sind nicht im LD_LIBRARY_PATH, und hoffentlich auch die Lösung, dass Sie selbsterklärend ist.
4.- Es ist ein tiefer compile/link-Fehler, d.h. das Paket ist nicht kompatibel mit dem rest der sw, oder wurde nicht korrekt portiert.