Hat ein R-compiler für C/C++ gibt es?

Ich wundere mich über die beste Methode zur Bereitstellung von R. Matlab hat die "matlab-compiler" (MCR). Dort hat gewesen Diskussion über etwas ähnliches in der Vergangenheit für R, zusammenstellen würde R in C oder C++. Hat jemand Erfahrung mit der R-C-Compiler (RCC), der entwickelt wurde von John Garvin auf Reis?

Ist, habe ich mich in Sie, und es scheint das einzige Projekt, das arbeitete an der Erstellung von R-code in ausführbaren code. Und soweit ich das beurteilen kann, ist es nicht noch verwendet wird.

[Edit 1:]: Zu sein klar, ich weiß, es gibt C und C++ (und Java, Python, etc.) Schnittstellen zu R (rJava, rcpp, Rpy, etc.). Ich wundere mich über bestimmte Wege, um zu kompilieren und bereitstellen von R-code, ohne die Installation von R im Voraus.

[Edit 2:]: John Mellor-Crummey sagt mir, dass Sie arbeiten immer noch auf RCC und hoffen, dass es in 4 Monaten oder so (frühestens). Ich werde diese zu aktualisieren, weiter, wenn ich alles andere finden Sie heraus.

InformationsquelleAutor Shane | 2009-09-20
  1. 35

    Einem byte-code-compiler Teil des R 2.13 release. Es ist standardmäßig nicht in dieser Version verwendet, aber es ist vorhanden; ich erwarte, dass die 2.14 release wird standardmäßig byte-kompilieren alle base und recommended Pakete. Der compiler::kompilieren der Hilfe-Seite und die R Installations-und Administrationshandbuch geben Sie einige weitere details.

    • Gibt es Hinweise / Richtlinien über die bei der Kompilierung wirksam sein wird? Mein erfolgreichster Versuch war bisher ein binäre Suche, mit 2x speedup; ich hatte insgeheim gehofft, dass die S4 würde sich wirklich schnell, aber kein solches Glück?
    • An dieser Stelle großen Funktionen und Schleifen werden davon profitieren. Aufruf kompiliert Funktionen verwendet denselben Mechanismus für jetzt als Aufruf interpretiert, so dass die Dinge dominiert von function-call overhead wenig verändern. Dies wird wahrscheinlich im Laufe des nächsten Jahres oder so.
    • Ich gebloggt ein Beispiel von heute konzentriert sich auf die (einfach, dumm, unrealistisch) - Schleifen: dirk.eddelbuettel.com/blog/2011/04/... ich bin sicher, es werden mehr Beiträge zu diesem, nachdem die R 2.13.0 wird offiziell veröffentlicht morgen.
    InformationsquelleAutor Luke Tierney
  2. 17

    Hatte ich vergessen, über das Reis-Projekt, hat es schon eine Weile. Ich denke, dass der operative Begriff ist hier angegeben an der Spitze der Projekt-Seite: Letzte Aktualisierung 3/8/06.

    Und wir alle wissen, dass R viel ändert. Also ich habe nur die standard paar Hinweise für Sie:

    • Luke Tierney, der weiß nicht nur eine Menge über die R-Interna, sondern ebenso über byte-Compiler, wurde die Arbeit an einem solchen Projekt. Nichts doch fertig, und es würde immer noch funktionieren in Verbindung mit dem standard-R-Motor.
    • Stephen Milborrow hat die Ra Erweiterung von R, der mit seinem just-in-time-compiler-Paket jit
    • meine Einführung in High-Performance-Computing mit R-tutorials (die letzten tutorial-Folien Nutzers! 2009) umfasst das profiling kompilieren von Erweiterungen, parallel computing mit R ... Teil, darunter
      Rcpp und und ein bisschen über
      RInside.

    Kurz: es gibt keinen Weg haben, was Sie sich wünschen bestimmten Weise zu kompilieren und bereitstellen von R-code, ohne die Installation von R im Voraus. Sorry.

    Edit/Update (April 2011): Luke ' s neue compiler Paket wird Teil der R 2.13.0 (veröffentlicht April 2011), aber nicht 'aktiviert' werden standardmäßig die voraussichtlich für R 2.14.0 erwartet für Oktober 2011.

    Edit/Update (Dezember 2011): Prof Tierney lassen Sie einfach eine massive 100+ Seiten Papier auf die byte-code-compiler.

    • Dank Dirk! Noch nicht ausgecheckt Luke ' s homepage vor kurzem. Ihre High-Performance-Computing-paper/tutorial ist fantastisch. Ich nahm das Datum der letzten Aktualisierung im Sinne von genau das, was Sie sagen, sondern wollte nur zu überprüfen. 🙂
    InformationsquelleAutor Dirk Eddelbuettel
  3. 6

    Warum bekommen die Leute Angst, wenn die Bereitstellung von R? Ich bin mir ziemlich sicher, dass ich gesehen habe diese Frage vor.

    Installation von R ist ein Stück Kuchen (Sie weiß nicht wirklich sagen, welche OS, die Sie interessieren). Für seine Fenster ein .exe. Datei, führen Sie es, sagen Sie "ja" ein paar mal und fertig. Ich vermute, dass der installer-exe hat wahrscheinlich flags für die unbeaufsichtigte installation zu.

    • R ist einfach. Einige Pakete und Ihre Abhängigkeiten sind nicht, insbesondere, wenn diese mit bestimmten anderen Sprachen. Java und Tcl/Tk in den Sinn kommen.
    InformationsquelleAutor Spacedman
  4. 3

    Können Sie check out der P-compiler implementiert eine Teilmenge von R. Insbesondere, Listen, Matrizen, Vektoren usw. umgesetzt werden sowie lsfit, chol, svd, ...

    Downloaden Sie eine Kostenlose version auf

    http://www.ptechnologies.org

    Es beschleunigt die Berechnungen erheblich.

    Besten,

    ALS

    • Es wäre noch überzeugender, wenn es nicht closed-source...
    InformationsquelleAutor AST
  5. 3

    Habe ich nicht verwendet, Garvin Paket und weiß nicht, was ist möglich, entlang dieser Linien. Allerdings:

    In der Regel Menschen, die nur schreiben, die rechenintensive Funktionen direkt in C/C++/Fortran, nach profiling um den Engpass zu finden. Finden Sie die RCpp-Schnittstelle oder Aufrufen von C-Funktionen aus R verwenden .C und .Rufen für Beispiele. Die Scythe Statistische Bibliothek ist auch sehr schön für die R-Benutzer, da die syntax/Funktion Namen ähnlich sind.

    • Danke, das sind gute links. Ich bin dabei insbesondere auf den deployment-Prozess, obwohl, weniger als das performance-Problem.
    InformationsquelleAutor Tristan
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