Hinzufügen einer Streuung der Punkte um einen boxplot mit matplotlib

Habe ich gesehen, diese wunderbare boxplot in dieser Artikel (Abb.2).

Hinzufügen einer Streuung der Punkte um einen boxplot mit matplotlib

Wie Sie sehen können, dies ist ein boxplot, auf denen überlagert ein scatter-schwarze Punkte: x-Indizes die schwarzen Punkte (in zufälliger Reihenfolge), y ist die variable von Interesse. Ich würde gerne etwas ähnliches machen mit Matplotlib, aber ich habe keine Ahnung, wo zu beginnen. So weit, die boxplots, die ich online gefunden haben, sind weit weniger cool und so Aussehen:

Hinzufügen einer Streuung der Punkte um einen boxplot mit matplotlib

Dokumentation von matplotlib:
http://matplotlib.org/api/pyplot_api.html#matplotlib.pyplot.boxplot

Wege zu Kolorieren boxplots:
https://github.com/jbmouret/matplotlib_for_papers#colored-boxes

InformationsquelleAutor Wok | 2015-04-21
  1. 18

    Was Sie suchen, ist ein Weg, um jitter der x-Achse.

    Etwas wie dieser aus hier:

    bp = titanic.boxplot(column='age', by='pclass', grid=False)
for i in [1,2,3]:
    y = titanic.age[titanic.pclass==i].dropna()
    # Add some random "jitter" to the x-axis
    x = np.random.normal(i, 0.04, size=len(y))
    plot(x, y, 'r.', alpha=0.2)

    Hinzufügen einer Streuung der Punkte um einen boxplot mit matplotlib

    Zitat aus dem link:

    Einen Weg, um zusätzliche Informationen zu einem boxplot ist die überlagerung der
    tatsächliche Daten; dies ist im Allgemeinen am besten geeignet mit klein - oder
    mittleren Datenreihe. Wenn Daten sind dicht, ein paar tricks
    oben verwendet Hilfe der Visualisierung:

    1. Verringerung der alpha-Ebene machen die Punkte die teilweise transparent
    2. hinzufügen zufälliger "jitter" entlang der x-Achse zu vermeiden overstriking

    Der code sieht so aus:

    import pylab as P
import numpy as np

# Define data
# Define numBoxes

P.figure()

bp = P.boxplot(data)

for i in range(numBoxes):
    y = data[i]
    x = np.random.normal(1+i, 0.04, size=len(y))
    P.plot(x, y, 'r.', alpha=0.2)

P.show()
    InformationsquelleAutor Kyrubas
  2. 13

    Erweiterung auf Kyrubas Lösung und mit nur matplotlib für das Plotten Teil (manchmal habe ich Schwierigkeiten beim formatieren pandas Diagramme mit matplotlib).

    from matplotlib import cm
import matplotlib.pyplot as plt
import pandas as pd
import numpy as np

# initialize dataframe
n = 200
ngroup = 3
df = pd.DataFrame({'data': np.random.rand(n), 'group': map(np.floor, np.random.rand(n) * ngroup)})

group = 'group'
column = 'data'
grouped = df.groupby(group)

names, vals, xs = [], [] ,[]

for i, (name, subdf) in enumerate(grouped):
    names.append(name)
    vals.append(subdf[column].tolist())
    xs.append(np.random.normal(i+1, 0.04, subdf.shape[0]))

plt.boxplot(vals, labels=names)
ngroup = len(vals)
clevels = np.linspace(0., 1., ngroup)

for x, val, clevel in zip(xs, vals, clevels):
    plt.scatter(x, val, c=cm.prism(clevel), alpha=0.4)

    Hinzufügen einer Streuung der Punkte um einen boxplot mit matplotlib

    • Für Python 3 Benutzer, müssen Sie wickeln Sie die Karte in einer Liste, etwa so: 'group': list(map(np.floor, np.random.rand(n) * ngroup))
    InformationsquelleAutor hwang
  3. 1

    Als eine einfachere, möglicherweise neuere option, die Sie nutzen könnten seaborn's swarmplot option.

    import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt

sns.set(style="whitegrid")
tips = sns.load_dataset("tips")

ax = sns.boxplot(x="day", y="total_bill", data=tips, showfliers = False)
ax = sns.swarmplot(x="day", y="total_bill", data=tips, color=".25")

plt.show()

    Hinzufügen einer Streuung der Punkte um einen boxplot mit matplotlib

    InformationsquelleAutor HS-nebula
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