igraph in R, so wählen Sie die Kanten, basierend auf den Vorfall vertex-Attribute?

Ich bin auf der Suche nach einem Weg, um Teilgraphen Kanten basierend auf einem vertex-Attribut-score von mindestens einer der Eckpunkte, die Störung auf diesem Rand.

Gibt es eine einfache Möglichkeit, dies zu tun?

Irgendwelche Vorschläge?

InformationsquelleAutor wake_wake | 2014-08-20

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Dieser Frage fehlt, ist ein reproduzierbare Beispiel oder jedes Beispiel, das Daten jeglicher Art. Ich werde ein Risiko einzugehen und beantworten Sie die Fragen auf, was ich denke, können Ist gefragt. Zunächst werde ich erstellen Sie eine Beispiel-Diagramm und ordnen Sie beliebig "prop" - Werte für jeden vertex. Ich werde Farbe, die Sie vorausgesetzt, ich bin interessiert in prop>=3 - und plot Ihnen.
```
library(igraph)

gg <- graph.atlas(711)
V(gg)$name <- 1:7
V(gg)$prop <- c(1,2,2,3,3,1,1)
V(gg)$color <- ifelse(V(gg)$prop>=3, "orange","yellow")
plot(gg)
```
Nun, kann ich alle Kanten verbunden, um ein vertex mit prop>=3 mit
```
E(gg)[inc(V(gg)[prop>=3])]
# Edge sequence:
#            
# [3]  4 -- 3
# [4]  5 -- 4
# [5]  6 -- 5
# [10] 5 -- 3
```
Und wenn ich, wie ich zu extrahieren, können diese an einer sub-graph mit
```
g2 <- subgraph.edges(gg, E(gg)[inc(V(gg)[prop>=3])])
plot(g2)
```
- Dank MrFlick! Das ist genau das, was ich suchte. Ich habe noch nie verwendet die 'inc' - Funktion. Vielen Dank!
- Sicher. Nur in der Zukunft, versuchen Sie, eine minimale reproduzierbare Beispiel. graph.atlas oder graph.famous können hilfreich sein für diese.
- Will ich auch! Danke!
- Gibt es eine Möglichkeit, kann ich den code ändern, so dass es nicht auch wählen Sie die Kanten, an denen ALLE Eckpunkte erfüllen prop>=3? Ich möchte wählen Sie die Patente, auf denen mindestens eine, aber nicht alle erfüllen prop>=3'. Kennen Sie einen Weg?
- Das ist ein bisschen ein anderes problem. Kommentare don ' T geben mir viel Raum, um zu erklären, aber ev<-get.edges(gg, E(gg)); exce<-xor(V(gg)[ev[,1]]$prop>=3, V(gg)[ev[,2]]$prop>=3); subgraph.edges(gg, E(gg)[exce]) sollte die Arbeit für dieses Beispiel. Im Grunde lässt sich ab der 4-5 Kanten.
- Dank MrFlick. Dies funktioniert in diesem Beispiel. Aber in meinem realen Daten, die ich haben Patente mit bis zu 31 Erfinder. Gibt es eine Möglichkeit das ich einstellen kann das Einschränkungen: wählen Sie, wenn mindestens eine erfüllt die Kriterien aber nicht auswählen, wenn Sie alle Kriterien erfüllen? Vielleicht sollte ich öffnen Sie eine neue Frage?
- Requisiten für die Einführung von mir zu den inc Funktion. Die Antwort hat mir geholfen, zu durchdenken und zu lösen mein problem.
InformationsquelleAutor MrFlick

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