Installieren xlsx und rJava auf macOS Mavericks 10.9.5

Den realen Albtraum zu installieren rjava auf meinem Mac.

Mein setup:

MacOS 10.9.5
Java: 7u71 (64 bits dowloaded from Oracle site)
R: R version 3.1.1 (2014-07-10)

Erste in der Befehlszeile den Befehl lief ich die 

sudo R CMD javareconf

Dann lief ich innen R:

install.packages('rJava')

Den Fehler am Ende der Zusammenstellung ist dieser:

JavaVM -F/opt/local/Library/Frameworks/R.framework/.. -framework R -llzma -lm -liconv -licuuc -licui18n
ld: library not found for -licuuc
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
make[2]: *** [libjri.jnilib] Error 1
make[1]: *** [src/JRI.jar] Error 2
make: *** [jri] Error 2
ERROR: compilation failed for package ‘rJava’
* removing ‘/Users/costa/Library/R/3.1/library/rJava’

Versuchte ich Java 8 und das Mac-Standard-java und habe auch den gleichen Fehler.

Ideias?

  • Ich glaube, ich hatte für die Installation der snow-leopard-build und es funktioniert einwandfrei
  • Ich habe versucht, die Verwendung dieser version: support.apple.com/kb/dl1573, aber ich konnte nicht installieren (mein Mac ist ein 10.9.5)
  • openxlsx ist eine schöne alternative, das hängt nicht von Java. github.com/cran/openxlsx
InformationsquelleAutor Menthor | 2014-11-05
  1. 4

    Was ich getan habe (mit macports R) als root (sudo bash):

    • Bearbeiten
      /opt/local/Library/Frameworks/R.framework/Resources/etc/Makeconf
      und ändern Sie die Zeile

      LIBS =  -llzma -lm -liconv -licuuc -licui18n

      zu

      LIBS =  -llzma -lm -liconv

    • installieren Sie die original 1.6 für Mac Java

    • export
      JAVA_HOME=/System/Library/Java/JavaVirtualMachines/1.6.0.jdk/Contents/Home

    • laufen R CMD javareconf

    Jetzt können Sie beginnen, R und eine install.packages("rJava"). Mit der 1.6 version von Java sorgte dafür, dass auch RStudio können, laden Sie das Paket rJava.

    Wenn Sie nicht Vorhaben, mit RStudio, können Sie auch Java 1.8

    • war für mich nur zum ändern der flags in der MakeconfDatei! Außerdem müssen Sie möglicherweise ausführen R CMD javareconf mit sudo.
    InformationsquelleAutor Detlef Engelbrecht
  2. 1

    Ich hatte den gleichen Fehler auf meinem computer (Mac OS 10.9.5, Java 1.8.0_11, R 3.1.1). Installation der neuesten Java JDK von Oracle (1.8.0_25) nicht das problem lösen (noch nicht). Jedoch, nach der Aktualisierung der Java Installation R 3.1.2 das problem bei mir gelöst. Nach dem ausführen install.packages("rJava") funktioniert:

    > library("rJava")
> .jinit() # this starts the JVM
> s <- .jnew("java/lang/String", "Hello World!")
> .jcall(s,"I","length")
[1] 12

    Tun, beachten Sie, dass die Aktualisierung der JDK ist etwas anderes als die Java-version in der GUI Java Control Panel, zugänglich über den System-Einstellungen. Das letztere ist nur die JRE für die internet-browser-plugin.

    InformationsquelleAutor Joqer
  3. 1

    Ich war tatsächlich in der Lage zu vermeiden, die Bearbeitung meiner Umgebung vollständig mit der Mac-Binär-zu installieren rJava auf meinem Macbook (unter OSX Yosemite und R version 3.2.3). Erste, gehen Sie folgendermaßen in R zu installieren rJava:

    install.packages("rJava", type = "mac.binary")

    Vermutlich unabhängig von diesem, aus irgendeinem Grund konnte ich nicht installieren, xlsx, bis ich das erste installiert die xlsxjars Abhängigkeit. Also, tun Sie den folgenden in R:

    install.packages(c("xlsxjars", "xlsx"))

    Und mit diesen zwei Befehlen, xlsx installieren angezeigt wird Prima auf einem mac!

    InformationsquelleAutor Dr. Arun
  4. 1

    Dieser arbeitete für mich:

    sudo R CMD javareconf

    Dann, in der R Interpret:

    install.packages('rJava', type='source')
install.packages('xlsx', type='source')
    • Ich bekomme Kompilierung fehlgeschlagen für rJava in dieser Phase: installieren.Pakete('rJava', Typ='Quelle')
    InformationsquelleAutor octavian
  5. 0

    Ich hatte das gleiche Problem. Ich bin mit OS X Yosemite und hatte zunächst installiert R durch homebrew

    Ich die folgenden Schritte durch, um es zu beheben:

    1. Geschlossen alle Instanzen von R
    2. In meinem terminal-shell, lief sudo R CMD javareconf

    3. Geöffnet R von meinem terminal und lief:

      install_packages("rJava")

      install_packages("xlsx")

    InformationsquelleAutor Ashwin Balamohan
  6. 0

    Über die alte Java SE 6 ich war in der Lage, rJava, zusammengestellt von laufen javareconf wie folgt:

    JAVA_HOME=/Library/Java/JavaVirtualMachines/1.6.0.jdk/Contents/Home \
JAVA_CPPFLAGS=-I/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.11.sdk/System/Library/Frameworks/JavaVM.framework/Versions/Current/Headers/ \
r CMD javareconf
    InformationsquelleAutor stephenhouser
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