Lesen von großen Dateien in Java — Java heap space

Lese ich ein großer tsv-Datei (~40G) und dem Versuch, zu beschneiden, es durch das Lesen Zeile für Zeile und drucken Sie nur bestimmte Zeilen in eine neue Datei. Aber ich bekomme immer folgende exception:

java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space
    at java.util.Arrays.copyOf(Arrays.java:2894)
    at java.lang.AbstractStringBuilder.expandCapacity(AbstractStringBuilder.java:117)
    at java.lang.AbstractStringBuilder.append(AbstractStringBuilder.java:532)
    at java.lang.StringBuffer.append(StringBuffer.java:323)
    at java.io.BufferedReader.readLine(BufferedReader.java:362)
    at java.io.BufferedReader.readLine(BufferedReader.java:379)

Unten ist der wichtigste Teil des Codes. Ich angegebenen Puffer-Größe 8192 nur für den Fall. Nicht Java deaktivieren Sie den Puffer, sobald die buffer size limit erreicht ist? Ich sehe nicht, was kann die Ursache für die große Arbeitsspeicher-Nutzung hier. Ich habe versucht, zur Erhöhung der heap-Größe, aber es machte keinen Unterschied (Maschine mit 4 GB RAM). Ich habe auch versucht, Spülen Sie die Ausgabe-Datei alle X Zeilen aber es hat auch nicht geholfen. Ich denke, vielleicht brauche ich, um Anrufe zu tätigen, um die GC, aber es klingt nicht richtig.

Irgendwelche Gedanken? Vielen Dank.
BTW - ich weiß, ich sollte rufen Sie trim() nur einmal auf, speichern es und verwenden es.

Set<String> set = new HashSet<String>();
set.add("A-B");
...
...
static public void main(String[] args) throws Exception
{
   BufferedReader reader = new BufferedReader(new InputStreamReader(new FileInputStream(inputFile),"UTF-8"), 8192);
   PrintStream output = new PrintStream(outputFile, "UTF-8");

   String line = reader.readLine();
   while(line!=null){
        String[] fields = line.split("\t");
        if( set.contains(fields[0].trim()+"-"+fields[1].trim()) )
            output.println((fields[0].trim()+"-"+fields[1].trim()));

        line = reader.readLine();
   }

output.close();

}