Pyinstaller numpy "Intel MKL FATAL ERROR: kann Nicht geladen werden mkl_intel_thread.dll"

Ich bin neu mit python apps. Ich versuchte, meine python-GUI-app mit pyinstaller.
Meine app hängt von den folgenden Paketen: PyQt4, numpy, pyqtgraph, h5py.
Ich arbeite mit WinPython-32bit-3.4.4.1.

Baue ich die app mit diesem Befehl:

pyinstaller --hidden-import=h5py.defs --hidden-import=h5py.utils --hidden-import=h5py.h5ac --hidden-import=h5py._proxy VOGE.py

Starte ich mein Programm mit der exe-Datei im Verzeichnis "dist" erstellt von pyinstaller, und es scheint, gut zu arbeiten, bis das Programm rufen Sie numpy und Absturz mit dieser Fehlermeldung:

Intel MKL FATAL ERROR: kann Nicht geladen werden mkl_intel_thread.dll

Den mkl_intel_thread.dll ist nicht im software-Verzeichnis; aber mit der Datei kopiert im root-Verzeichnis des Programms bekam ich den gleichen Fehler

Vielen Dank für Ihre Hilfe

InformationsquelleAutor f_ciriolo | 2016-02-18

1

Erstellte ich eine hook-numpy.py um mit diesem problem umzugehen:
```
from PyInstaller import log as logging 
from PyInstaller import compat
from os import listdir

libdir = compat.base_prefix + "/lib"
mkllib = filter(lambda x : x.startswith('libmkl_'), listdir(libdir))
if mkllib <> []: 
   logger = logging.getLogger(__name__)
   logger.info("MKL installed as part of numpy, importing that!")
   binaries = map(lambda l: (libdir + "/" + l, ''), mkllib)
```
In meinem Fall conda installiert die mkl-Bibliotheken zu beschleunigen numpy und scipy.
- Danke. Ihr fix hat mein problem gelöst. Aber jetzt habe ich erkannt, dass, wenn meine app aufrufen, Funktion in Bezug auf die pyqtgraph es Absturz mit dem gleichen Fehler: die Intel MKL FATAL ERROR: kann Nicht geladen werden mkl_intel_thread.dll
- Ist das eine andere app? es ist der Absturz mit dem gleichen Fehler?
- Nein, die selbe app auch pyqtgraph. Wenn ich jetzt führen Sie die exe-genereted von pyinstaller es läuft gut, bis eine Funktion, die die Nutzung pyqtgraph ist genannt danach ihn zum Absturz zu bringen mit der Intel MKL FATALER FEHLER. Bevor Ihr fix den Absturz vorzeitig
- Verwirrend, meine intuition ist, dass Sie mit verschiedenen Python-Paket-management-Systeme für pyqtgraph und numpy. Ich würde empfehlen, dass Sie bauen den man-dir-app und führen Sie es dann mit einer Spur verfolgen die Bibliotheken geladen werden.
- Ich Baue mit ein-dir (default). Sorry aber ich bin neu in python was du genau meinst mit "laufen Sie mit einer trace-tracking"? Ich Strecke die Bibliothek laden auf die ausführbare Datei oder auf dem original .py?
InformationsquelleAutor LeonidR
8

Ich hatte das gleiche Problem mit Pyinstaller und Numpy. Standardmäßig pyinstaller scheint nicht berücksichtigt numpy-Binärdateien, so dass Sie haben, um dieses manuell einzugeben. Sie können die Dateien Bearbeiten ".spec" - Datei "binaries" - variable, aber das wird nur arbeiten für Ihr Aktuelles Programm. Wenn Sie wollen, dass es Arbeit für alle Programme, die Ihrer einzufrieren sollten Sie einen "Haken" und speichern Sie es in C:\Python3*\Lib\site-packages\PyInstaller\Haken.

Musste ich anpassen LeonidR code, um die numpy-hook arbeiten. Ich rewrited es mithilfe eines modernen, pythonic Ansatz, die Liste Verstehens:
```
from PyInstaller import log as logging 
from PyInstaller import compat
from os import listdir

mkldir = compat.base_prefix + "/Lib/site-packages/numpy/core" 
logger = logging.getLogger(__name__)
logger.info("MKL installed as part of numpy, importing that!")
binaries = [(mkldir + "/" + mkl, '') for mkl in listdir(mkldir) if mkl.startswith('mkl_')] 
```
"Binaries" ist eine Liste von Tupeln. Das zweite Element des Tupels entspricht dem Ordner, wo Sie wollen zu platzieren, die 'dlls'. In diesem Fall ist leer, also es kopiert Sie direkt in den main Ordner, wo Ihr '.exe " ist.
- Können Sie bitte erläutern Sie es ? Ich bin vor dem gleichen problem, aber ich verstehe nicht, dass Wenn ich hook.py und speichern Sie es auf C:\Python3*\Lib\site-packages\PyInstaller\hooks wie nenne ich es in meinem code so, dass er liest-Datei ?
- Diese fast arbeitete für mich, aber wie andere darauf hingewiesen, dass libiomp5md.dll ist auch nötig, modifizierte ich die Letzte Zeile zu: Binärdateien = [(mkldir + "/" + mkl, ") für die mkl in listdir(mkldir) wenn mkl.startswith('mkl_') oder mkl.startswith('libio')]
InformationsquelleAutor j4n7
2

Ich lief in das gleiche problem. Als workaround habe ich kopiert die DLL ' s manuell ein, wie beschrieben in https://stackoverflow.com/a/34893933/4089081

Ich versuche eine bessere Lösung zu finden, obwohl.

InformationsquelleAutor durox
1

Ich nur update-numpy+mkl auf die neueste version, die Sie herunterladen können numpy+mkl aus hier
- Dies ist meine Lösung auch.
InformationsquelleAutor Hailin FU

j4n7's Antwort war sehr hilfreich, aber es kann oder kann nicht buggy sein. compat.base_prefix verwendet umgekehrte Schrägstriche (zumindest für mich), aber Sie dann verketten mit "/Lib/site-packages/numpy/core" (Schrägstriche).

>>> from PyInstaller import compat
>>> compat.base_prefix
'C:\\Python34'
>>> mkldir = compat.base_prefix + "/Lib/site-packages/numpy/core"
>>> mkldir
'C:\\Python34/Lib/site-packages/numpy/core'

Wie Sie sehen können, es produziert sowohl vorwärts-und rückwärts-Schrägstriche im Pfad.

Hier sind meine Schritte, die mir erlaubt, zu bündeln numpy mkl-Dateien in onefile. Beachten Sie, dass meine bestimmte app verwendet, matplotlib und das problem, das ich erlebte war jedesmal, wenn ich eine Schaltfläche geklickt (tkinter) zur Ausführung der Handlung, ist die app abgestürzt ist.

Schritte

Ersten: Machen Sie einen build der app mit:

pyinstaller --onefile --windowed yourpythonappnamehere.py

Zweiten: Öffnen Sie die .spec - Datei und fügen Sie diese an es. Offensichtlich stellen Sie sicher, dass die unter-Dateien tatsächlich erst existieren. Möglicherweise haben Sie nicht Python34 also nur eine freundliche Warnung nicht darum, blind zu kopieren.

mkl_dlls = [('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_avx.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_avx2.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_avx512.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_core.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_def.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_intel_thread.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_mc.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_mc3.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_rt.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_sequential.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_tbb_thread.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_vml_avx.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_vml_avx2.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_vml_avx512.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_vml_cmpt.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_vml_def.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_vml_mc.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_vml_mc2.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\mkl_vml_mc3.dll', ''),
 ('C:\\Python34\\Lib\\site-packages\\numpy\\core\\libiomp5md.dll', '')]

Dritten: wo sagt er binaries=None ändern binaries=mkl_dlls.

a = Analysis(['yourpythonappnamehere.py'],
             pathex=['C:\\Users\\...\\Documents\\...'],
             binaries=mkl_dlls,
             datas=None,
             ....

Vierten: Re-run der ersten Schritt. Wenn Ihre app gebaut wird, gehen in die dist Ordner und starten Sie Ihre app. Ich hoffe, es funktioniert für Sie!

UPDATE: Wenn Sie Intel MKL FATAL ERROR: kann Nicht geladen werden mkl_intel_thread.dll aber man kann deutlich sehen, dass mkl_intel_thread.dll IST IN Ihrem Programm-Verzeichnis, gehen Sie zu numpy/core und buchstäblich kopieren Sie alle Dateien, die mit .dll-Erweiterungen, die Sie nicht haben, und fügen Sie Sie in Ihr Programm-Verzeichnis und re-run. Wenn es funktioniert, toll, aber möchten Sie vielleicht zu löschen ein zu einer Zeit, um herauszufinden, welche Sie brauchen und welche Sie nicht.

InformationsquelleAutor Jarad

Ich aktualisiert das snippet zu bekommen, es funktioniert mit meiner anaconda installation (der Pfad ist anders):

from PyInstaller import log as logging
from PyInstaller import compat
from os import listdir
from os.path import join

mkldir = join(compat.base_prefix, "Library", "bin")
binaries = [(join(mkldir, mkl), '') for mkl in listdir(mkldir) if mkl.startswith('mkl_')]

Update: Das geht eben nur für windows. Ich sah auch, dass es eine PR auf github eine genauere beheben. Sehen Sie diese Begehen

InformationsquelleAutor maggie

0

Hatte ich 2 Versionen von Python installiert. Eine basic-version von Python installiert, die von Anaconda. Wann läuft meine machine-learning-Skript, das hat den gleichen Fehler. Wenn ich die deinstallation einer der beiden Versionen (in meinem Fall habe ich entfernt Anaconda) alles funktioniert wieder. Ich benutze deeplearning4j Bibliotheks-und offensichtlich hat es Schwierigkeiten, diese dll zu beheben, denn es gibt es mehrere Python-Installationen installiert.

InformationsquelleAutor Bart Van Miegem

Schreibe einen Kommentar

Du musst angemeldet sein, um einen Kommentar abzugeben.