Tag: scipy

SciPy ist eine open-source Bibliothek von algorithmen und mathematischen Werkzeuge für die Programmiersprache Python.

Wie kann ich mit scipy.ndimage.interpolation.affine_transform um ein Bild zu drehen, über seine Mitte?

Anzahl der Antworten 3 Antworten
Ich bin verwirrt durch die API zu scipy.ndimage.interpolation.affine_transform. Und die Beurteilung durch dieses Problem ich bin nicht der einzige. Ich bin eigentlich zu wollen, mehr tun, interessante Dinge mit affine_transform als nur das Bild drehen, aber eine

Zeigen, Konfidenzintervalle und Grenzen in der Vorhersage scatter-plot

Anzahl der Antworten 4 Antworten
Ich habe zwei arrays von Daten, wie Höhe und Gewicht: import numpy as np, matplotlib.pyplot as plt heights = np.array([50,52,53,54,58,60,62,64,66,67,68,70,72,74,76,55,50,45,65]) weights = np.array([25,50,55,75,80,85,50,65,85,55,45,45,50,75,95,65,50,40,45]) plt.plot(heights,weights,'bo') plt.show() Ich gerne produzieren möchte, der plot ähnlich dieser: http://www.sas.com/en_us/software/analytics/stat.html#m=screenshot6 Irgendwelche Ideen, sehr

Python MemoryError, wenn dabei die Montage mit Scikit-learn

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Ich verwende Python 2.7 (64-bit) auf eine Windows 8 64-bit-system mit 24GB Speicher. Bei der Montage der üblichen Sklearn.linear_models.Ridge, der code läuft einwandfrei. Problem: Allerdings, wenn Sie Sklearn.linear_models.RidgeCV(alphas=alphas) für den Einbau, ich Lauf in den MemoryError Fehler

Bild erosion und Dilatation mit Scipy

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Ich versuche, mit scipy zu tun erosion und Dilatation eines Bildes. Es scheint ziemlich einfach, mit scipy -> binary_erosion /dialation. Die Ausgabe wird jedoch überhaupt nicht, was erwartet wird. Hier ist mein basic-code: import scipy from scipy

Matplotlib.Pyplot nicht zeigen-Ausgang; Kein Fehler

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Meine Plattform ist wie folgt Centos 6.x (VirtualBox VM läuft auf Win-7-host), Python 2.6.6, Matplotlib 1.3.1, Numpy 1.8.0, Scipy 0.14.0.dev-bb608ba Ich bin mit den unten histogram.py code #!/usr/bin/env python import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt

Immer die r-Quadrat-Wert mit curve_fit

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Ich bin ein Anfänger mit den beiden Python und alle seine libs. Aber ich habe es geschafft, ein kleines Programm, das funktioniert wie vorgesehen. Es nimmt eine Zeichenfolge, zählt das auftreten verschiedener Buchstaben und plottet Sie in

Seltsam SciPy ODE Integration Fehler

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Ich bin die Implementierung eines sehr einfachen Susceptible-Infected-Recovered-model mit einem stabilen Bevölkerung für ein idle-Seite des Projekts - in der Regel eine ziemlich einfache Aufgabe. Aber ich bin mit in solver-Fehler mit entweder PysCeS oder SciPy, die

Wie import Scipy und Numpy Python?

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Ich bin sehr neu in Python und hinzufügen möchten, Numpy und Scipy-Modul. Ich denke, meine Frage ist sehr einfach für Sie. Ich bin mit Python 3.06 ein.1-version. Ich denke, dass ich schon etwas installiert namens Anaconda, enthält

scipy.misc.Ableitung für mehrere argument-Funktion

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Es ist unkompliziert, zu berechnen, die partiellen Ableitungen einer Funktion an einem Punkt mit Bezug auf das erste argument mit Hilfe der SciPy-Funktion scipy.misc.derivative. Hier ist ein Beispiel: def foo(x, y): return(x**2 + y**3) from scipy.misc import

pd.rolling_mean immer veraltet - alternativen für ndarrays

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Sieht es aus wie pd.rolling_mean ist immer veraltet ndarrays, pd.rolling_mean(x, window=2, center=False) FutureWarning: pd.rolling_mean ist veraltet ndarrays und wird in einer zukünftigen version entfernt aber es scheint der Schnellste Weg, dies zu tun, nach diese SO beantworten.

Wie man die Werte von ein NumPy-array mit mehreren Indizes

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Habe ich ein NumPy-array, dass wie folgt aussieht: arr = [100.10, 200.42, 4.14, 89.00, 34.55, 1.12] Wie kann ich mehrere Werte aus diesem array per index: Zum Beispiel, wie bekomme ich die Werte an den index-Positionen 1,

Was ist der Schnellste Weg, um schneiden Sie ein scipy.sparse-matrix?

Anzahl der Antworten 2 Antworten
Verwende ich normalerweise matrix[:, i:] Scheint es nicht so schnell arbeiten, wie ich es erwartet habe. Sinn des benchmarking ist es für uns? vielleicht sogar timeit? InformationsquelleAutor todpole3 | 2012-12-12

Lesen Sie die Daten von einem einzelnen Kanal einer stereo-wave-Datei in Python

Anzahl der Antworten 2 Antworten
Habe ich zum Lesen der Daten aus einem Kanal in einem stereo-wave-Datei in Python. Für diese versuchte ich es mit scipy.io: import scipy.io.wavfile as wf import numpy def read(path): data = wf.read(path) for frame in data[1]: data

Numpy und Scipy installation auf windows

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Ich habe Numpy installiert, erfolgreich. Aber auf der Website , es gibt viele Dinge, die ich zu tun haben, wie beispielsweise der Bau von Numpy, Scipy, Download ATLAS, LAPACK, etc. Ich bin wirklich verwirrt und auch ich

Zweite Ableitung in Python - scipy/numpy/pandas

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Ich versuche es mit einem zweiten Ableitung in python mit zwei numpy arrays von Daten. Zum Beispiel die arrays, die in Frage, die wie folgt Aussehen: import numpy as np x = np.array([ 120. , 121.5, 122.

Schnellste paarweisen Distanz-Metrik in python

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Ich habe ein 1D array von zahlen, und Sie möchten berechnen Sie alle paarweisen euklidischen Distanzen. Ich habe eine Methode (Dank SO), dies zu tun, mit Ausstrahlung, aber es ist ineffizient, weil es berechnet jede Strecke zweimal.

Aufgetreten Ungültiger Wert wenn ich pearsonr

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Vielleicht habe ich einen Fehler gemacht. Wenn ja, tut mir Leid das zu Fragen. Möchte ich berechnen Pearson correlation coefficent durch die Verwendung von scipy ist pearsonr Funktion. from scipy.stats.stats import pearsonr X = [4, 4, 4,

Die meisten effizienten Art und Weise zu konstruieren-ähnlichkeit-matrix

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Bin ich über die folgenden links, um eine "euklidische Ähnlichkeit Matrix" (die ich konvertieren, um ein DataFrame). https://stats.stackexchange.com/questions/53068/euclidean-distance-score-and-similarity http://docs.scipy.org/doc/scipy-0.14.0/reference/generated/scipy.spatial.distance.euclidean.html Den Weg, die ich mache es ist ein iterativer Ansatz, der funktioniert, aber es dauert eine Weile, wenn

Hochrechnung von Daten mit numpy/python

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Sagen wir, ich habe einen einfachen Datensatz. Vielleicht in dictionary form, würde es so Aussehen: {1:5, 2:10, 3:15, 4:20, 5:25} (die Reihenfolge ist immer aufsteigend). Was ich tun will ist logischerweise, herauszufinden, was der nächste Punkt der

Einbau-Distributionen, goodness-of-fit, p-Wert. Ist es möglich, dies zu tun mit Scipy (Python)?

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EINLEITUNG: ich bin ein Bioinformatiker. In meiner Analyse, die ich durchführen auf alle menschlichen Gene (etwa 20 000) ich Suche eine bestimmte kurze Sequenz-Motiv, um zu überprüfen, wie viele Male dieses Motiv tritt in jeder gen. Gene

ECDF in python ohne Schritt-Funktion?

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Ich habe mit ECDF (empirical cumulative distribution function) von statsmodels.Ausschüttungen an eine CDF-plot der Daten. Allerdings ECDF verwendet eine Schritt-Funktion und als Konsequenz bekomme ich gezackte Grundstücke. Also meine Frage ist: scipy oder statsmodels haben eine ECDF

numpy/scipy/ipython:Fehler beim interpretieren der Datei als eine Gurke

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Habe ich die Datei im folgenden format: 0,0.104553357966 1,0.213014562052 2,0.280656379048 3,0.0654249076288 4,0.312223429689 5,0.0959008911106 6,0.114207780917 7,0.105294501195 8,0.0900673766572 9,0.23941317105 10,0.0598239513149 11,0.541701803956 12,0.093929580526 Möchte ich zur Handlung diesen Punkt mit ipython plot-Funktion wie folgt: In [40]: mean_data = load("/Users/daydreamer/data/mean") Aber

Lesen von Matlab Daten-Datei in Python, Müssen Sie Sie Exportieren in CSV

Anzahl der Antworten 2 Antworten
Habe ich gelesen, die eine Matlab-Datei mit einer großen Menge von arrays wie ein dataset in Python speichern Sie die Matlab-Wörterbuch unter dem Variablennamen mat mit dem Befehl: mat = loadmat('Sample Matlab Extract.mat') Gibt es eine Möglichkeit,

Kann Paket nicht finden auf Anaconda-Navigator. Was als Nächstes zu tun?

Anzahl der Antworten 2 Antworten
Ich versuche zu installieren "pulp" - Modul in Anaconda Navigator Umgebung tabs. Aber wenn ich die Suche in "Alle" Pakete, die ich nicht finden kann. Es geschah mit anderen Paketen auch. Gibt es eine Möglichkeit, zu installieren,

extrahieren von pitch-Funktionen aus der audio-Datei

Anzahl der Antworten 3 Antworten
Ich versuche zum extrahieren von pitch-Funktionen von einer audio-Datei, die ich verwenden würde, für eine Klassifizierung problem. Ich bin mit python(scipy/numpy) für die Einstufung. Ich denke, ich kann die Frequenz Funktionen mit scipy.fft aber ich weiß nicht,

Wahrscheinlichkeits-Dichte-Funktion aus dem Histogramm in python fit anderen histrogram

Anzahl der Antworten 1 Antworten
Ich habe eine Frage bezüglich Einbau und erste Zufallszahlen. Situation ist wie folgt: Erstens habe ich ein Histogramm aus den Daten Punkte. import numpy as np """create random data points """ mu = 10 sigma = 5

Lowpass Filter in python

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Ich versuche konvertieren von Matlab-code auf Python. Ich möchte zu implementieren fdesign.lowpass() von Matlab in Python. Was die genaue Ersatz von dieses Matlab-code mit scipy.signal.firwin(): demod_1_a = mod_noisy * 2.*cos(2*pi*Fc*t+phi); d = fdesign.lowpass('N,Fc', 10, 40, 1600); Hd

Schiebe-Fenster mit as_strided Funktion numpy?

Anzahl der Antworten 3 Antworten
Bekommen wie ich zu implementieren, die eine gleitende Fenster auf Basis von python, um Objekte zu erkennen, die in sich noch Bilder, die ich kennenlernen-nette Funktion: numpy.lib.stride_tricks.as_strided Also habe ich versucht zu erreichen, eine Allgemeine Regel zu

Wie um zu überprüfen, BLAS/LAPACK-Kopplung in NumPy und SciPy?

Anzahl der Antworten 5 Antworten
Ich bin builing meine numpy/scipy-Umgebung, basierend auf blas-und lapack-mehr oder weniger basierend auf diese Spaziergang durch. Wenn ich damit fertig bin, wie kann ich überprüfen, dass meine numpy/scipy Funktionen wirklich tun, verwenden Sie die zuvor erstellte blas/lapack-Funktionen?

Warum wird von scipy import-räumliche arbeiten, während scipy.Geo funktioniert nicht nach dem import scipy?

Anzahl der Antworten 2 Antworten
Möchte ich scipy.spatial.distance.cosine in meinem code. Kann ich den import der spatial Submodul wenn ich etwas mache, wie import scipy.spatial oder from scipy import spatial, aber wenn ich einfach import scipy aufrufen scipy.spatial.distance.cosine(...) Ergebnisse in die folgende

Gewusst wie: Bearbeiten von wav-Datei in Python?

Anzahl der Antworten 1 Antworten
Ich versuche zu Lesen, eine wav-Datei, dann manipulieren Sie die Inhalte, sample-by-sample Hier ist, was ich habe, so weit: import scipy.io.wavfile import math rate, data = scipy.io.wavfile.read('xenencounter_23.wav') for i in range(len(data)): data[i][0] = math.sin(data[i][0]) print data[i][0] Den

numpy recfromcsv und genfromtxt überspringt die erste Zeile der Daten-Datei

Anzahl der Antworten 3 Antworten
numpy ist recfromcsv überspringt die erste Zeile meiner Daten. (Das gleiche gilt für genfromtxt) import numpy as np filename = 'data.csv' writer = open(filename,mode='w') writer.write('0,1.1,1.2\n1,2.1,2.2\n2,3.1,3.2') writer.close() data = np.recfromcsv(filename) print data Ist das ein bug, oder wie

Lösen einer Gleichung mit scipy ist fsolve

Anzahl der Antworten 3 Antworten
Ich versuche, lösen Sie die Gleichung f(x) = x-sin(x) -n*t -m0 In dieser Gleichung n und m0 sind Attribute, die definiert werden in meiner Klasse. Weiter t ist eine Konstante ganze Zahl in der Gleichung, aber es

Lineare Programmierung mit scipy.optimieren.linprog

Anzahl der Antworten 1 Antworten
Habe ich einfach mal die einfache lineare Programmierung problem mit scipy.optimieren.linprog: 1*x[1] + 2x[2] -> max 1*x[1] + 0*x[2] <= 5 0*x[1] + 1*x[2] <= 5 1*x[1] + 0*x[2] >= 1 0*x[1] + 1*x[2] >= 1 1*x[1]

Auslesen von Bildern in python

Anzahl der Antworten 5 Antworten
Ich versuche zu Lesen ein png Bild in python. Die imread Funktion in scipy wird veraltet und Sie empfehlen imageio Bibliothek. Aber ich bin lieber einschränken, meine Verwendung von externen Bibliotheken, um scipy, numpy und matplotlib Bibliotheken.

Anpassung der Höhen der einzelnen subplots in matplotlib Python

Anzahl der Antworten 2 Antworten
wenn ich eine Reihe von Nebenhandlungen mit einer Spalte und vielen Zeilen, d.h.: plt.subplot(4, 1, 1) # first subplot plt.subplot(4, 1, 2) # second subplot # ... wie kann ich passen Sie die Höhe der ersten N

Einbau einer geschlossenen Kurve zu einer Reihe von Punkten

Anzahl der Antworten 4 Antworten
Habe ich eine Reihe von Punkten pts die form einer Schleife und es sieht wie folgt aus: Dies ist etwas ähnlich wie Eins und dreißig Millionen zwei hundert drei und vierzig tausend zwei, aber anstatt Punkte in

Berechnung der Korrelationskoeffizienten zwischen den zwei multi-dimensional arrays

Anzahl der Antworten 2 Antworten
Ich habe zwei arrays, die die Formen N X T und M X T. Ich möchte die Berechnung der Korrelationskoeffizienten über T zwischen jedem möglichen paar Zeilen n und m (aus N und M, beziehungsweise). Was ist

neue pythonic Stil für die gemeinsamen Achsen quadratischen subplots in matplotlib?

Anzahl der Antworten 2 Antworten
Bezug auf: Plotten autoscaled Geschichten mit festen Grenzen in matplotlib Ich würde gerne eine Reihe von Nebenhandlungen, die sich alle auf den gleichen Maßstab, mit dem subplots neuen, kompakten Stil, wie in http://matplotlib.org/api/pyplot_api.html#matplotlib.pyplot.subplots haben und Sie werden

Berechnung der Korrelationskoeffizienten zwischen den zwei multi-dimensional arrays

Anzahl der Antworten 2 Antworten
Ich habe zwei arrays, die die Formen N X T und M X T. Ich möchte die Berechnung der Korrelationskoeffizienten über T zwischen jedem möglichen paar Zeilen n und m (aus N und M, beziehungsweise). Was ist

Ein Werkzeug zum konvertieren von MATLAB-code zu Python

Anzahl der Antworten 3 Antworten
Ich habe eine Reihe von MATLAB-code von meinem MS these, die ich jetzt konvertieren möchten, um Python (mit numpy/scipy und matplotlib) und verteilen als open source. Ich weiß, die ähnlichkeit zwischen MATLAB und Python wissenschaftlichen Bibliotheken, und

Interpolieren großen unregelmäßigen raster auf ein anderes unregelmäßigen raster in Python

Anzahl der Antworten 1 Antworten
Ich versuche zu interpolieren komplexe Werte von einem unregelmäßigen raster auf eine andere unregelmäßige raster mit Python. Die Gitter sind in 2D und es gibt 103,113 Daten Punkte. Ich bin mit Python 2.6.6, Scipy 0.7.2, Numpy 1.3.0,

Wie man glatte Kontur gefüllt in matplotlib?

Anzahl der Antworten 1 Antworten
Hallo, ich Versuch Grundstück eine gefüllte Kontur des unebenen Daten. die ist in drei Listen. Mein problem hier ist, kann ich nicht in der Lage zu bekommen glatte Kontur gefüllt. was ich gemacht habe ist zuerst änderte

Installation von numpy in PyCharm auf Windows

Anzahl der Antworten 1 Antworten
Ich erhalte Fehler, wenn ich versuche, installieren Sie numpy in Pycharm (Windows) Dies ist die Fehlermeldung die ich bekomme C:\Python27\lib\distutils\dist.py:267: UserWarning: Unbekannt Vertrieb option: 'define_macros' Warnungen.warnen(msg) Fehler: Unable to find vcvarsall.bat Gibt es einen einfacheren Weg, um

Mit einem denke, mit scipy curve_fit

Anzahl der Antworten 1 Antworten
Ich habe eine Funktion, ich möchte Kurvenanpassung mit dem wissen der Fehler der Kurvenanpassung. Ich versuche, scipy.optimieren.curve_fit dies zu tun, aber bin knapp in problem. Jetzt mein code ist: import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt

Gewusst wie: zuweisen von scipy.sparse matrix zu NumPy-array über die Indizierung?

Anzahl der Antworten 2 Antworten
Wenn ich versuche weisen eine scipy.lichten matrix s (alle verfügbaren spärlichen Arten), um ein NumPy-array a wie diese: a[:] = s Bekomme ich eine TypeError: TypeError: float() argument muss eine Zeichenkette oder eine Zahl Gibt es eine

Was ist die dimension, um von numpy Form für Bild-Daten?

Anzahl der Antworten 1 Antworten
Ich bin mit nibabel lib zum laden von Daten von nii-Datei. Ich lese das Dokument der lib an http://nipy.org/nibabel/gettingstarted.html, und festgestellt, dass Dieser Informationen ist ohne die Notwendigkeit zu laden, alles von der Haupt-Bild-Daten in den Speicher.

Nicht gegossen-array-Daten von dtype('O') , dtype('float64')

Anzahl der Antworten 4 Antworten
Ich bin mit scipy ist curve_fit zu passen, eine Funktion, um einige Daten, und Sie erhalten die folgende Fehlermeldung; Cannot cast array data from dtype('O') to dtype('float64') according to the rule 'safe' welche Punkte mich zu dieser

python - wie man die Fläche unter der Kurve?

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möchte Sie Fragen, ob es möglich ist, berechnen Sie die Fläche unter der Kurve für eine angepasste distribution curve? Die Kurve würde so Aussehen Ich habe gesehen, einige online-Beiträge in Bezug auf die Nutzung von trapz, aber

Plot der 2D-FFT eines Bildes

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Ich versuche, die Handlung der 2D-FFT des Bildes: from scipy import fftpack, ndimage import matplotlib.pyplot as plt image = ndimage.imread('image2.jpg', flatten=True) # flatten=True gives a greyscale image fft2 = fftpack.fft2(image) plt.imshow(fft2) plt.show() Aber ich bekomme TypeError: Image