Wie kann ich verlängern Sie die Kanten in einem igraph Netzwerk-plot (layout=fruchterman.reingold)?

Versuchen zu tun, ein Netzwerk Grundstück in R.
Wie kann ich verlängern Sie die Kanten in einem Netzwerk-Diagramm mit IGraph?

Will ich eigentlich verwenden, die fruchterman-reingold-layout. Gibt es eine Möglichkeit, ich kann das force-based Algorithmus "springier", so dass meine Eckpunkte sind weiter auseinander?

Dank.

  • Keine Lösung für dass?
InformationsquelleAutor Monica | 2011-05-11
  1. 16

    Können Sie Steuern, die Fruchterman-Reingold-Algorithmus mit der layout.fruchterman.reingold Funktion. siehe: help('layout.fruchterman.reingold'). Ein setup, dass ich es oft verwenden und bekommt Sie ein wenig mehr Abstand ist:

    l <- layout.fruchterman.reingold(g,niter=500,area=vcount(g)^2.3,repulserad=vcount(g)^2.8)
plot(g,layout=l)

    wo g ist Ihr graph-Objekt. Am besten testen Sie einfach verschiedene Werte dieser Parameter für Ihr Diagramm und sehen, was funktioniert. Vor allem repulserad beeinflusst den Abstand in einem Diagramm. Die Standardeinstellung ist das Quadrat der Zahl der Knoten, also höhere Werte bekommen sollten Sie mehr Abstand Diagramme.

    • "Argument " repulserad' ist veraltet und hat keine Auswirkungen", zumindest in v. 1.0.1 . .
    • Alle Lösungen zu den veralteten problem?
    InformationsquelleAutor Sacha Epskamp
  2. 7

    Wenn die layout.fruchterman.reingold Algorithmus noch nicht gibt, was Sie wollen, durch anpassen der Parameter, tun Sie einfach Folgendes. Jedes layout gibt eine Reihe von Koordinaten mit der x - und y-Koordinate in der ersten und zweiten Spalte jeweils. Sie können sich bewerben jede transformation, die Sie, wie hier, und wenn Sie möchte nur, um es zu skalieren, verwenden Sie einfach

    L = layout.fruchterman.reingold(G)*s; #Scaling factor s

    Mehr Lust Transformationen sind natürlich auch möglich. Nur für das Protokoll, können Sie auch Bearbeiten Sie das layout manuell mit der Maus durch die Verwendung tkplot(G, layout=L). Sie können die Koordinaten zurück über L = tkplot.getcoords(1).

    • Skalierung durch eine Konstante hat keine Auswirkung, es sei denn, Sie geben rescale=FALSE parameter der igraph::plot Funktion
    InformationsquelleAutor Vincent Traag
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