Wie zu sagen, welche Pakete Sie verwendet haben, in der R

Ich bin nicht sicher, ob eine gute Art und Weise zu automatisieren... aber was Sie tun können, ist:

1. Öffnen Sie ein neues R-Konsole

2. Check mit sessionInfo dass Sie müssen nicht zusätzliche Pakete geladen.
   
   Du könntest dies überprüfen, mithilfe sessionInfo. Wenn Sie standardmäßig das laden von zusätzlichen Paketen (z.B. über Ihre .RProfile-Datei) ich schlage vor, Sie vermeiden tun, es ist ein Rezept für eine Katastrophe.
   
   Normalerweise sollten Sie nur die Basis-Pakete sind geladen: stats, graphics, grDevices, utils, datasets, methods, und base.

   Können Sie entladen irgendwelche zusätzlichen Bibliotheken mit:

   detach("package:<packageName>", unload=TRUE)

3. Führen Sie nun das Skript nach kommentieren der library und require anrufen und sehen, welche Funktionen geben einen Fehler aus.

4. Zu bekommen, welches Paket benötigt wird, durch jede Funktion geben in der Konsole ein:

   ??<functionName>

5. Laden Sie die gewünschten Pakete und re-führen Sie die Schritte 3-5, bis zufrieden.

Basierend auf jeder Antwort, vor allem eh21's Vorschlag der NCmisc Paket, ich zusammen eine kleine Funktion gibt eine Liste der Pakete in alle R-Skripte in einem Verzeichnis, sowie Ihrer Frequenzen.

library(NCmisc)
library(stringr)
library(dplyr)

checkPacks<-function(path){

    ## get all R files in your directory
    ## by the way, extract R code from Rmd: http://felixfan.github.io/extract-r-code/
    files<-list.files(path)[str_detect(list.files(path), ".R$")]

    ## extract all functions and which package they are from 
    ## using NCmisc::list.functions.in.file
    funs<-unlist(lapply(paste0(path, "/", files), list.functions.in.file))
    packs<-funs %>% names()

    ## "character" functions such as reactive objects in Shiny
    characters<-packs[str_detect(packs, "^character")]

    ## user defined functions in the global environment
    globals<-packs[str_detect(packs, "^.GlobalEnv")]

    ## functions that are in multiple packages' namespaces 
    multipackages<-packs[str_detect(packs, ", ")]

    ## get just the unique package names from multipackages
    mpackages<-multipackages %>%
               str_extract_all(., "[a-zA-Z0-9]+") %>%
               unlist() %>%
               unique()
    mpackages<-mpackages[!mpackages %in% c("c", "package")]

    ## functions that are from single packages
    packages<-packs[str_detect(packs, "package:") & !packs %in% multipackages] %>%
              str_replace(., "[0-9]+$", "") %>%
              str_replace(., "package:", "") 

    ## unique packages
    packages_u<-packages %>%
                unique() %>%
                union(., mpackages)

    return(list(packs=packages_u, tb=table(packages)))

}

checkPacks("~/your/path")

Ich hatte ein ähnliches brauchen, wenn ich brauchte, um meine konvertieren-code in ein Paket, so muss ich erkennen jedes Paket Abhängigkeit und entweder import oder die Verwendung voll Qualifizierter name.

In ein Buch liest Extending R fand ich XRtools::makeImports können scan ein Paket und alle Pakete müssen importiert werden. Dies löst nicht unser problem noch, da es nur für das vorhandene Paket, aber es ist die wichtigste Einsicht auf, wie es zu tun.

Ich habe eine Funktion und legen Sie es in mein Paket mischelper. Sie können das Paket installieren, verwenden Sie entweder die RStudio-add-in-Menü scan aktuelle Datei oder den ausgewählten code, oder verwenden Sie command line Funktionen. Jede externe Funktion (fun_inside), und die Funktion, die es aufgerufen (Nutzung) werden aufgeführt in der Tabelle.

Gehen Sie jetzt auf jede Funktion, drücken Sie F1, um herauszufinden, welches Paket es gehört. Ich habe eigentlich ein anderes Paket, das scan alle installierten Pakete für function-Namen und bauen eine Datenbank, aber das kann zu mehr false positives für diese Verwendung, denn wenn Sie erst einige Pakete geladen, drücken Sie F1 auf der Suche nach geladenen Pakete.

Sehen Sie die details der Nutzung meiner Seite Paket

https://github.com/dracodoc/mischelper