Installieren Sie R auf der RedHat-Fehler, die auf Abhängigkeiten, die nicht existieren

Habe ich installiert, R, bevor Sie auf einem Rechner mit RedHat EL6.5, aber vor kurzem hatte ich ein problem bei der Installation von neuen Paketen (also die Installation.Pakete()). Da konnte ich nicht eine Lösung finden, ich habe versucht neu zu installieren R:

sudo yum remove R

und

sudo yum install R

Aber jetzt bekomme ich:

....
---> Package R-core-devel.x86_64 0:3.1.0-5.el6 will be installed
--> Processing Dependency: blas-devel >= 3.0 for package: R-core-devel-3.1.0-5.el6.x86_64
--> Processing Dependency: libicu-devel for package: R-core-devel-3.1.0-5.el6.x86_64
--> Processing Dependency: lapack-devel for package: R-core-devel-3.1.0-5.el6.x86_64
---> Package xz-devel.x86_64 0:4.999.9-0.3.beta.20091007git.el6 will be installed
--> Finished Dependency Resolution
Error: Package: R-core-devel-3.1.0-5.el6.x86_64 (epel)
           Requires: blas-devel >= 3.0
Error: Package: R-core-devel-3.1.0-5.el6.x86_64 (epel)
       Requires: lapack-devel
Error: Package: R-core-devel-3.1.0-5.el6.x86_64 (epel)
       Requires: libicu-devel
 You could try using --skip-broken to work around the problem
 You could try running: rpm -Va --nofiles --nodigest

Ich schon geprüft, und blas-devel ist installiert, aber die neueste version 0.2.8. Überprüft mit:

yum info openblas-devel.x86_64

Irgendwelche Gedanken, was mache ich falsch? Danke.

  • Eine oberflächliche Suche nach blas-devel in google zeigt, dass die neueste version ist mindestens version 3.2. Sie wahrscheinlich verwendet, um eine ältere version von R installiert und die neuere version hängt von der version von BLAS nicht in RedHat?
  • Können dies lösen, indem sudo yum install lapack-devel usw.. bis die Fehler aufhören.
  • sudo yum install lapack-devel funktioniert nicht. Zurück: No package lapack-devel available. Scott - Sie haben Recht, dass blas-devel ist nicht verfügbar in der yum. Was ist der beste Weg, dies zu beheben?
InformationsquelleAutor Jon | 2014-07-11
  1. 8

    Ich hatte das gleiche Problem. Nicht sicher, warum diese Pakete fehlen von RHEL ' s repos, aber Sie sind in CentOS 6.5, so dass die Folgen der Lösung arbeiten, wenn Sie wollen, um die Dinge in das Paket-Paradigma:

    wget http://mirror.centos.org/centos/6/os/x86_64/Packages/lapack-devel-3.2.1-4.el6.x86_64.rpm
wget http://mirror.centos.org/centos/6/os/x86_64/Packages/blas-devel-3.2.1-4.el6.x86_64.rpm
wget http://mirror.centos.org/centos/6/os/x86_64/Packages/texinfo-tex-4.13a-8.el6.x86_64.rpm
wget http://mirror.centos.org/centos/6/os/x86_64/Packages/libicu-devel-4.2.1-9.1.el6_2.x86_64.rpm
sudo yum localinstall *.rpm

    cheers

    UPDATE: Leon ' s Antwort ist besser-siehe unten.

    • Bei der Installation von texinfo-tex-5.1-4.el7.x86_654, beschwert es sich über erfordern tex(epsd.tex), aber ich habe keine Ahnung, welches Paket versorgt, dass. Dies ist auf RHEL7, offensichtlich (und mit CentOS7-Pakete).
    • Sind Sie versuchen zu installieren, mit rpm oder yum? yum sollte versuchen, Abhängigkeiten aufzulösen.
    • Es war yum, sich zu beschweren. Hinzufügen der entsprechenden CentOS-repo /etc/yum.repos.d vorübergehend und dann die Installation einfach die fehlenden Abhängigkeiten, dann entfernen und installieren von R wurde das Problem behoben. Es ist anscheinend ein Problem/bug mit dem RHEL-Paket-Abhängigkeiten. Ich musste vorsichtig sein, um sicherzustellen, das alle anderen Pakete kamen aus den RHEL-repos, nicht CentOS, damit nicht eine gute Idee, installieren Sie R sich selbst, wenn die CentOS-repo aktiv ist.
    • Froh, dass Sie es herausgefunden hat. Wenn ich stolperte über dieses Letzte Jahr war ich auch überrascht, dass die Centos-repos schien mehr als RHEL.
    • Sie sind in der RHEL optional RPMs. Sehen Sie, Leon ' s Antwort.
    InformationsquelleAutor Owen
  2. 16

    Folgendes tun:

    1. vim /etc/yum.repos.d/redhat.repo -
    2. Ändern enabled = 0 in [rhel-6-server-optional-rpms] - Abschnitt der Datei aktiviert=1
    3. yum install R

    GETAN!

    Ich denke, ich sollte geben, Verweis auf die Website der Lösung:

    https://bluehatrecord.wordpress.com/2014/10/13/installing-r-on-red-hat-enterprise-linux-6-5/

    • Werke für RHEL7 mit [rhel-7-server-optional-rpms] zu ändern.
    InformationsquelleAutor Leon
  3. 1

    Die beste Lösung, ich könnte kommen mit war, um aus dem Quellcode installieren. Das hat funktioniert und war nicht allzu schlimm. Aber jetzt ist es nicht in meinem Paket manager.

    InformationsquelleAutor Jon
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