Java/R Interface (JRI)

Möchte ich nennen, einige R-code aus Java, auf einer Linux-Maschine, die R bereits installiert, so dass das Java/R Interface (JRI) benötigt.

Allerdings bin ich mir nicht sicher, wie gehen über diese.

Den JRI homepage sagt, dass das Paket gebündelt in rJava. Also, ich heruntergeladen rJava-0.9.3.tar.gz aus der rJava Files-Sektion, und entpackt es, sich (unter anderem) eine Menge von Java-source-Dateien (und die entsprechenden Klassen) in der src/java Ordner, plus 2 Gläser (JRIEngine.jar und REngine.jar) in der inst/jri Ordner.

Den JRI Files-Sektion, wenn, zusätzlich zu den oben genannten 2 Gläser, auch JRI.jar und alle drei dieser Bibliotheken sind Aktueller als die 2 in inst/jri.

Darüber hinaus keiner dieser 3 Gläser enthält die Binärdateien für die Klassen, die sich im Verzeichnis src/java, die notwendig erscheinen, die für das aufrufen von R aus in Java.

Ausführen von "make all" in der java/src Ordner scheint, führen Sie einfach einige tests und kein GLAS produziert wird.

Ich würde erwarten, dass alle notwendigen Klassen kommen, gebündelt in JAR-Dateien, so dass Sie könnte leicht Hinzugefügt werden, in der classpath-und IDE-Projekte (z.B. in Eclipse).

Wie kann ich dahin kommen?

InformationsquelleAutor PNS | 2012-02-29
  1. 4

    Verwenden install.packages("rJava") im R - Installation rJava umfasst JRI. Erhalten Sie den gleichen Effekt mit R CMD INSTALL rJava_0.9-3.tar.gz. Beide sind die dokumentierten Möglichkeiten zur Installation von R-Paketen. Stellen Sie sicher, dass das JDK installiert und konfiguriert R mit Java-Unterstützung vor. Einmal installiert, können Sie Fragen R über die Lage des JRI mit system.file("jri",package="rJava")

    Beachten Sie, dass zur Nutzung JRI Sie benötigen, um den setup-Umgebung richtig (in der Regel mit R CMD), und setzen Sie java.library.path gehören die JRI Lage. Können Sie Scannen möchten, mit der stats-rosuda-devel mailing-Liste, ist der kanonische Ort, um Fragen über rJava/JRI.

    • Danke für die Antwort. Ich lese über das installieren.Pakete () - Befehl war aber verwundert wie ich das machen würde, das Ergebnis der Arbeit mit Eclipse. Ich habe jetzt führen Sie es und fügte hinzu, eine Anwender-Bibliothek in Eclipse, dass Punkte auf die 3 JAR-Dateien installiert. Da Eclipse kümmert sich um Java-bezogenen Pfad Erklärungen, wenn das funktioniert out of the box?
    • Nein, JAR-Dateien alleine sind nicht genug - Sie müssen stellen Sie sicher, Sie haben java.library.path setup zu finden JRI dynamische Bibliothek und auch die benötigten Umgebungsvariablen, indem R, wie R_HOME. Ich benutze nicht Eclipse, also ich weiß nicht, wie es verarbeitet die Einstellungen. Sie können einen Blick auf die run Skript und die JRI Beispiele.
    • In der Tat. R_HOME werden, können in den Projekt - > Einstellungen - > Run/Debug-Einstellungen, in der Erwägung, dass für die ld.Bibliothek.paht kann man Bearbeiten, die "Native library" - Einstellung in jedes der 3 Gläser JRI (wie in diesem StackOverflow-post: stackoverflow.com/questions/957700/...).
    • Zwei hilfreiche Beiträge über die Einrichtung rJava und JRI in Eclipse: stackoverflow.com/questions/3311940/... und binfalse.de/2011/02/talking-r-through-java
    InformationsquelleAutor Simon Urbanek
Schreibe einen Kommentar