NAMESPACE nicht generiert roxygen2. Übersprungen. - Verwirrung mit der Hadley-Buch

Ich versuche, ein Paket, aber wenn ich laufen document() es druckt NAMESPACE not generated by roxygen2. Skipped. ich versuche, mit ggplot2,XML, R6 Pakete in meine Funktionen. Ich bin importieren Sie Sie in der folgenden Weise:

#' @rdname visualization
#' @param hist_data A table of weather variables with PWS created by hist_data function
#' @param variable A character string of variable name
#' @examples
#' table <- getWeather(city = "San Francisco", state="CA")
#' please <- getConditionsTable(table, "2015-03-09")
#' tab <- hist_data(table, please)
#' head(tab)
#' plot_variable_across_all_pws(hist_data=tab, variable="tempi")
#' @import ggplot2
#' @import XML
#' @import R6

Frage ich mich, was könnte die Ursache dieser Fehler und es ist nichts in meinem Namespace außer für exportPattern("^[^\\.]")

Auch, wollte ich über R-Pakete-Buch von Hadley http://r-pkgs.had.co.nz/namespace.html
Und verwirrt durch die Zeile :

"Beachten Sie, dass Sie können wählen, um roxygen2 zu generieren, nur NAMESPACE, nur man/*.Rd, oder beides. Wenn Sie keine namespace Verwandte tags, roxygen2 nicht touch-NAMESPACE. Wenn Sie nicht mit jeder Dokumentation, die tags, roxygen2 nicht Anfassen wenn man/."

Ist das, was ich falsch mache? oder fehlt?

  • Haben Sie versucht, indem Sie die Importe in die BESCHREIBUNG der Datei statt? roxygen2 nicht jemals zu berühren, dass die Datei
InformationsquelleAutor hi15 | 2015-03-19
  1. 19
    1. Backup NAMESPACE-Datei, wenn Sie es brauchen für die zukünftige Verwendung
    2. Löschen Sie die Datei NAMESPACE
    3. Laufen devtools::document(), so dass roxygen2 generieren, die neue NAMESPACE-Datei in das paketquellverzeichnis

    *** stellen Sie sicher, Sie haben @export tag in der roxygen2 doc Abschnitt der R-Quellcode-Datei.

    InformationsquelleAutor Sathish
  2. 13

    Ich denke, dass devtools versucht zu vermeiden überschreiben BESCHREIBUNG und NAMESPACE-Dateien, die es nicht alleine (zur Vermeidung von angst, wenn Sie sorgfältig tippte Sie an sich selbst, statt mit eingebetteten roxygen-Kommentare in Ihrem r-code). Es ist nicht immer möglich, aber versucht es.

    Der wichtigste Mechanismus, wie ich es verstehe, ist post einen Kommentar am Anfang der Datei, wenn es erzeugt die Datei, und dann später, nach diesem Kommentar (es sind knifflige bits um die Kante, zum Beispiel, wenn Sie verwenden @includes zu erstellen, die Sortieren die Reihenfolge, in der BESCHREIBUNG der Datei, aber ich glaube nicht, dass dein problem hier).

    Ein Beispiel für einen solchen Kommentar ist

    # Generated by roxygen2 (4.1.0.9001): do not edit by hand

    Den not generated by ... Nachricht ist, das Sie alarmiert, und lassen Sie wissen devtools ist nicht zu verwenden roxygen2 um eine NAMESPACE-Datei für Sie. Sie müssen möglicherweise die, die Sie erwähnen, ohne Kommentar, weil Sie RStudio verwendet, um starten Sie Ihr Paket, sondern als devtools::create() ?

    Wenn Sie löschen Sie einfach die NAMESPACE-Datei, ich denke devtools::document() würde dann für Sie arbeiten.

    BTW Sie haben einen Tippfehler im Beispiel-code oben (Sie haben#' @import ggplo2 statt #' @import ggplot2)

    InformationsquelleAutor Geoff
  3. 1

    Auch man kann einfach alles löschen aus dem NAMESPACE und fügen Sie verlassen eine Zeile: exportPattern("^[[:alpha:]]+")

    Wenn die Datei NAMESPACE manuell geändert devtools::document() schlägt fehl, überschreiben Sie diese Datei, das ist, warum es Blätter wie vorher. Wenn Sie den text löschen aus dem NAMESPACE-Datei und fügen Sie diese Zeile ein, devtools::document() denkt, dass die Datei neuer ist und überschreibt es.

    • Könntest du bitte erläutern Sie mehr Ihre Antwort das hinzufügen von ein wenig mehr Beschreibung über die Lösung, die Sie bereitstellen?
    • Wenn die Datei NAMESPACE manuell geändert wurde, devtools::document() nicht überschreiben Sie diese Datei, das ist, warum es Blätter wie vorher. Wenn Sie den text löschen aus dem NAMESPACE-Datei und fügen Sie diese Zeile ein, devtools::document() denkt, dass die Datei neuer ist und überschreibt es.
    InformationsquelleAutor irudnyts
  4. 0

    Keines der obigen Beispiele, die für mich gearbeitet. Wenn ich Sie gelöscht, die NAMESPACE Datei dann roxygen beschwert, es gab keine NAMESPACE. Wenn ich Sie gelöscht und neu erstellt eine NAMESPACE - Datei (mit `touch, z.B. RStudio: Gebäude-Paket mit roxygen2. Nicht die NAMESPACE-Datei) dann roxygen sich beschwert, dass die Datei nicht erstellt wurde mit roxygen.

    Die Lösung war die Kopie einer NAMESPACE Datei aus einem anderen Projekt, dass war erstellt mit roxygen.

    InformationsquelleAutor jsta
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