Regression Tabellen in Markdown-format (für den flexiblen Einsatz im R Markdown-v2)

Die neue version von R Markdown basiert auf pandoc, so können Sie leicht ändern Sie das output-format.

Mein Problem ist, markdown formatierte Tabellen aus z.B. regression-Modelle, da LATEX-und HTML-Tabellen, die nicht überleben, die pandoc-Konvertierung.

Ich weiß-Pakete, die erzeugt LATEX/HTML-Ausgabe aus einer Vielzahl von Modellen (stargazer, texreg, asprtable...) und ich bin mir dessen bewusst Funktionen/Pakete, erzeugen die markdown-Tabellen aus data-frames und Matrizen, aber nicht von anderen Objekten.

Irgendwelche Vorschläge?

Versuchen pander dass ich anfing, für genau diesen Zweck: rapporter.github.io/pander Und Roman arbeitet derzeit an der Umsetzung Haufen neue S3-Methoden im GSoC 2014, so viele Modelle sind bereits enthalten-aber pls fühlen sich frei, um vorzuschlagen, weitere feature-Anfragen an GH.
schöne Arbeit
Vielen Dank, das passt einige meiner Bedürfnisse! Gibt es eine Möglichkeit in pander, zeigen Ergebnisse von einem - Serie von regressionsmodellen?
ja, siehe z.B. github.com/Rapporter/pander/pull/80

InformationsquelleAutor sammerk | 2014-06-21

knitr pandoc r r-markdown

Meine oben im Kommentar mehr details:

Definieren ein paar Modelle für eine reproduzierbare Beispiel:

lm0 <- lm(hp ~ wt, mtcars)
lm1 <- lm(qsec ~ hp, mtcars)
lm2 <- lm(qsec ~ wt, mtcars)

Erstellen Sie eine vergleichende Tabelle von denen:

require(memisc)
mtable123 <- mtable('Model 1' = lm0,
            'Model 2' = lm1,
            'Model 3' = lm2,
            summary.stats = c('R-squared','F','p','N'))

Rendern markdown-Tabelle mit einem einfachen Aufruf pander:
```
pander(mtable123)
```

Genießen Sie das Ergebnis:

--------------------------------------------------
     &nbsp;        Model 1    Model 2    Model 3  
----------------- ---------- ---------- ----------
 **(Intercept)**   -1.821\   20.556***\ 18.875***\
                   (32.325)   (0.542)    (1.103)  

     **wt**       46.160***\     \       -0.319\  
                   (9.625)               (0.328)  

     **hp**           \      -0.018***\     \     
                              (0.003)             

  **R-squared**     0.434      0.502      0.031   

      **F**         22.999     30.190     0.945   

      **p**         0.000      0.000      0.339   

      **N**           32         32         32    
--------------------------------------------------

Danke für Roman Tsegelskyi für die Umsetzung dieses nette feature im GSoC 2014.

Ich sehe, vielen Dank für die details. Gut, es ist definitiv nicht ein markdown Frage und eher nicht relevant in diesem thread, also wenn ich du wäre, würde ich anfangen eine neue Frage auf, SO. Ansonsten Suche nach folgenden keywords: benutzerdefinierte CSS mit knitr.
bitte stellen Sie sicher, dass Sie über die aktuelle version von pander, da es sehr veraltet auf CRAN. Ich werde schieben Sie ein update gibt es in den nächsten Wochen.
Sie stricken aus RStudio? Wahrscheinlich startet er einen vanilla R Sitzung ohne Belastung knitr oder so etwas. Ich habe gerade schob einem möglichen update auf GH, installieren Sie bitte den dev-version von pander und lassen Sie mich wissen, wenn es funktioniert.
ja, das ist es, was ich hast gestern 🙂 Und aufgrund einer neuen update in pander, es gibt keine Notwendigkeit, geben Sie results='asis' mehr in Ihre chunk-Optionen beim Aufruf pander.
Ich scheine immer: "Warnung in Schüren.Standard(m): Keine Vorschub leisten.Methode für "memisc_mtable"" wenn ich versuche zu tun, wie Sie vorschlagen.

InformationsquelleAutor daroczig

4

Generieren Sie einfach den HTML-oder LATEX-Tabellen. Alles was Sie tun müssen ist, fügen Sie einfach Ergebnisse='asis', um die code-chunk. Es wird das Ergebnis so wie es ist.

Beispielsweise diesen code mit xtable für mich funktioniert.
```
```{r,results='asis'}
x<-rnorm(100)
y<-rnorm(100)
lm <- lm(y~x)
library(xtable)
print(xtable(summary(lm)),type='html')
```
```
könnten Sie sind ein minimal-Beispiel, zusammen mit einer Erklärung auf, wie um es zu kompilieren?

InformationsquelleAutor Koundy
2

Hier, was ich getan habe vor ein paar Stunden:
1. Einige Daten:
```
```{r}
  lm1 <- lm(qsec ~ hp, mtcars)
  lm2 <- lm(qsec ~ wt, mtcars)
```
```
2. Verwenden wir das Paket sjPlot
```
```{r}
  library(sjPlot)
  tab_model(lm1,lm2, file="output.html")# You have to save the table in html format.
```
```
  Den nächsten Teil muss außerhalb der chunk in markdown:
htmltools::includeHTML("output.html")

Das funktioniert nicht
könnte, fügen Sie ein minimales Beispiel arbeiten?
Das funktioniert bei mir nicht, könnten Sie fügen Sie ein minimal-Beispiel, bitte 🙂
Behoben. Sorry für den Fehler
'sjt.lm' ist veraltet. Verwenden Sie 'tab_model' statt.

InformationsquelleAutor Cro-Magnon

Andere Weise zu verwenden sjPlot (große Bibliothek für die einfache Präsentation von regression-Ausgang) ist die Verwendung der nicht.die Ausgabe-feature:

     library(sjmisc)
     library(sjPlot)
     library(magrittr)

     lm(qsec ~ wt, mtcars) %>% 
       sjt.lm(no.output = TRUE, show.se = TRUE) %>% 
       return() %>% .[["knitr"]] %>% asis_output

InformationsquelleAutor HoneyBuddha

0

Ich aktualisiere dieses mit einem Beispiel, die beliebten (und neuere) knitr und kableExtra Pakete.
```
library(knitr)
library(xtable)

lm(hp ~ wt, mtcars) %>%
summary() %>%
xtable() %>%
kable()
```
Nun können Sie auf alle kühl-Tabelle-Formatierung features, die in Hao Zhu ' s kableExtra Paket.

Kann das Modell-Vergleich?

InformationsquelleAutor John J.
0

Die huxtable-Paket kann nun schön formatiert print-regression Tabelle.
Finden Sie in der API https://hughjonesd.github.io/huxtable/huxreg.html

InformationsquelleAutor cderv

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