Stricken gibt parse error

In dem Versuch zu stricken PDF-Datei. Ich rufe ein Skript, das zurückkehren sollte, zwei ggplots durch den Aufruf der chunk:

```{r, echo=FALSE}

read_chunk('Script.R')

```r

Aber die Fehlermeldung

processing file: Preview-24a46368403c.Rmd

 Quitting from lines 9-12 (Preview-24a46368403c.Rmd)  Error in
 parse(text = x, srcfile = src) :    attempt to use zero-length
 variable name Calls: <Anonymous> ... <Anonymous> -> parse_all ->
 parse_all.character -> parse Execution halted

Das Skript auf seine eigenen Läufe und gibt die beiden plots, aber nicht zurückkehren, wenn Sie strickte.

Ebenso versucht, auf source()
Aber habe einen ähnlichen Fehler 

 Quitting from lines 7-10 (Preview-24a459ca4c1.Rmd)  Error in
 file(filename, "r", encoding = encoding) :    cannot open the
 connection Calls: <Anonymous> ... withCallingHandlers -> withVisible
 -> eval -> eval -> source -> file Execution halted
InformationsquelleAutor GregdeLima | 2015-07-09
  1. 7

    Während dieses nicht zu sein scheinen eine Lösung für Sie, das genau die gleiche Fehlermeldung erscheint, wenn der chunk nicht ordnungsgemäß beendet.

    Erlebte ich diesen Fehler, und verfolgt Sie zu Ende chunk mit ` statt ``. Korrigieren Sie die syntax der Block gelöst ist das problem, das ich erlebt, die mit der gleichen Fehlermeldung wie du.

    • Ich denke, dies ist die häufigste Ursache für diesen Fehler. Dieser arbeitete für mich.
    InformationsquelleAutor Will Scott
  2. 0

    Sind Sie sicher, dass knitr Ausführung aus dem Verzeichnis, das Sie denken es ist? Es scheint, dass es nicht die Datei finden.

    • ein absoluter Pfad verwendet werden, wenn dieses es regelt, haben Sie Ihr problem gefunden
    • sobald Sie das getan haben, können Sie opts_knit$set(root.dir = "...") - nicht verwenden setwd(.) wenn Sie es wollen (die cwd) aufrecht zu erhalten.

    Knitr ist dies standardmäßig das Verzeichnis der .Rmd Datei selbst.

    • Ich habe den absoluten Pfad hier: source("c:/users/me/documents/Script.R") opts_knit$set(root.dir = "c:/users/me/documents/") Aber ich bin noch immer Quitting from lines 7-11 (Preview-24a43ec36ef0.Rmd) Error in file(file, ifelse(append, "a", "w")) : cannot open the connection Calls: <Anonymous> ... write.csv -> eval.parent -> eval -> eval -> write.table -> file Execution halted1
    • Es bekam. Haben Sie versucht, direkt kopieren Sie den Inhalt von Skript.R in der .Rmd Datei? Wenn Sie haben, und das funktioniert, dann ist es sicherlich ein problem mit dem, was read_chunk erwartet und was Sie sind vorbei, aber um das zu Debuggen, müssen wir den Inhalt Skript.R
    InformationsquelleAutor jimmyb
  3. 0

    Kann es zu tun haben mit dem "r" am Ende der drei backquotes Abgrenzung Ihrer code-chunk. Es sollte nichts nach dem triple backquotes, aber ich denke, das problem ist konkret, dass der Buchstabe "r".

    Die Frage ergibt sich aus der Tatsache, dass R markdown Prozesse backquoted-Anweisungen beginnend mit r als inline-code, bedeutet es tatsächlich läuft, was zwischen den backquotes.

    Ich hatte ähnliche Probleme schreiben, ein problem in einer Rmd-mit dieser Aussage hatte backquoted text soll monospace aber nicht als inline-code:

    Verwenden sapply oder map zur Berechnung der Wahrscheinlichkeit eines Ausfalls rate über r <- seq(.05, .5, .025).

    Wenn ich Stricke das Dokument, ich habe undurchsichtige Fehlermeldungen sagen, ich hatte eine falsche Zuordnung mit <-. War es denn anstatt nur die Anzeige der backquoted Anweisung in monospace, r <- seq(.05, .5, .025) war tatsächlich bearbeitet werden wie R-inline-code <- seq(.05, .5, .025)...so ist die unsachgemäße Zuordnung Fehler. Ich heftete meine Fehler durch ändern der variable name aus r zu rate.

    Den text der Fehlermeldung in deine Frage beziehen könnte, was folgt, dein code-Brocken, wie der wirkprozess wird wahrscheinlich versuchen zu laufen, dass als code. In diesem Fall nur das entfernen, dass streunende r am Ende der code-chunk sollte den Fehler beheben.

    InformationsquelleAutor Amy Gill
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