Tag: qsub
Qsub ist ein job Vorlage Befehl für high-performance-computing-jobs.
wie man die job-id aus qsub
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Ich bin mit einem cluster. Ich werde qsub-Befehl zu verteilen, mein job, was ich will, ich kann wieder die job-id, so dass ich beobachten können, den job. Grundsätzlich möchte ich einige Sache wie diese: #!/bin/bash JOBID=$( qsub
'Unexpected end of file "oder" error importing function definition " - Fehler shellscript mit qsub
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Habe ich Folgendes shellscript: #!/bin/sh cd /sw/local/bin/ export LD_LIBRARY_PATH=/sw/local/lib:/usr/local/Trolltech/Qt-4.7.2/lib:$LD_LIBRARY_PATH ./FeatureFinderRaw -in /homes/JG-C1-18.mzML -out /homes/test_remove_after_use.featureXML -threads 20 Es funktioniert, wenn ich es aus meiner eigenen Kommando-Zeile, aber wenn ich versuche zu tun: qsub -q ningal.q -cwd -V -o
Tut qsub übergeben Sie Befehl Linie Argumente, um mein Skript?
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Wenn ich behaupte, dass ein job mit qsub script.sh ist $@ eingestellt auf einen Wert innerhalb script.sh? Das heißt, gibt es irgendwelche Kommandozeilen-Argumente übergeben script.sh? InformationsquelleAutor becko | 2014-10-21
Argument übergeben .sh-Skripte
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Habe ich ein shell-Skript foo.sh was ist ein qsub job mit Inhalt: #!/bin/bash -l #$ -S /bin/bash #$ -N $2 echo $1 Möchte ich zwei Argumente. Wenn ich den Anruf qsub foo.sh a b das erste argument
ohne Knoten, aus dem qsub Befehl unter sge
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Habe ich mehr als 200 jobs, die ich übergeben zu müssen und sge-cluster. Ich werde Sie Ihnen in zwei ques. Einer der ques eine Maschine haben, die ich nicht wollen, um Druckaufträge an. Wie kann ich ausschließen,
parameter für shell-Skripte, die gestartet wird mit qsub
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wie kann ich einstellen, ein shell-Skript, das ausgeführt wird, auf einem raster (beginnend mit qsub) ? Ich habe ein shell-Skript, wo ich getopts zum Lesen der Parameter. Wenn ich starte (qsub script.sh -r firstparam -s secondparam ..)
Warten Sie, bis der Satz von Qsub-Jobs abgeschlossen ist
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Habe ich eine batch-script startet ein paar qsub jobs, und ich möchte Sie auffangen, wenn Sie sind alle fertig. Ich nicht wollen, verwenden Sie die sync-option, weil ich will, dass Sie gleichzeitig ausgeführt werden. Jeder job hat
wie man die Fehlerprotokolldatei und die Ausgabedatei in qsub angibt
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Ich habe eine qsub Skript als #####----submit_job.sh---##### #!/bin/sh #$ -N job1 #$ -t 1-100 #$ -cwd SEEDFILE=/home/user1/data1 SEED=$(sed -n -e "$SGE_TASK_ID p" $SEEDFILE) /home/user1/run.sh $SEED Das problem ist-es bringt alle Fehler-und Ausgabe-Dateien (auftrag1.eJOBID & auftrag1.oJOBID) im gleichen