Warum rJava nicht auf Ubuntu 14.04 mit OpenJDK 7?

Hallo, ich habe Probleme mit dem rJava-Paket von cran.

Habe ich installiert

sudo apt-get install openjdk-7-jdk
sudo apt-get install r-cran-rjava

ran und

sudo R CMD javareconf
# Java interpreter : /usr/bin/java
# Java version     : 1.7.0_55
# Java home path   : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre
# Java compiler    : /usr/bin/javac
# Java headers gen.: /usr/bin/javah
# Java archive tool: /usr/bin/jar

Ich versuche dann zu laufen, R-und Last-rJava und die folgende Fehlermeldung erhalten:

R
> library(rJava)
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/usr/lib/R/site-library/rJava/libs/rJava.so':
  libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory
Error: package or namespace load failed for ‘rJava’

Bin ich auf Ubuntu 14.04 64 bit und bin mit R version 3.1.0 (2014-04-10) -- "Spring Dance"

UPDATE: Eigentlich ist dies nicht spezifisch für OpenJDK, ich habe gerade versucht oracle java 8 und bekam das gleiche Ergebnis. Auch ich fand diese Problemumgehung hierdie ich nur ungern verwenden, da es ist in der Tat ein workaround und nicht wirklich erklären, warum es notwendig ist. Das Paket-system haben sollten, behandelt das meiner Meinung nach. Scheint, wie libjvm.also ist das problem und ich habe es hier

/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/jamvm/libjvm.so
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so
/usr/lib/jvm/java-7-oracle/jre/lib/amd64/server/libjvm.so

und für einige Grund rJava schlägt fehl, um Sie zu finden, trotz Aktualisierung mit sudo R CMD javareconf.

UPDATE 2: es kommt noch dicker: Wenn ich R wie sudo funktioniert es.

Dankbar für Hinweise.

InformationsquelleAutor der Frage Dr. Mike | 2014-05-05

  1. 7

    Ich hatte das gleiche problem mit ähnlicher Konfiguration (R 3.1.0, Ubuntu 12.10, 32 bit). Ich fand die Antwort war immer LD_LIBRARY_PATH richtig gesetzt, wie hier beschrieben:
    error: unable to load installiert die Pakete gerade jetzt außer, dass das Unterverzeichnis in Frage ist 'client' nicht 'server'. So jetzt hab ich die Einstellung meiner Umgebung so:

    export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386
export LD_LIBRARY_PATH=$JAVA_HOME/jre/lib/i386:$JAVA_HOME/jre/lib/i386/client

    InformationsquelleAutor der Antwort persistentNoob

  2. 7

    War ich in der Lage, dies zu lösen, permanentelly mit dieser Antwort: https://stackoverflow.com/a/25932828/3939832

    Dies ist nützlich, wenn Sie Oracle java 7 oder 8 installiert sein. Export von Variablen in meinem Fall war das nicht eine dauerhafte Lösung. Sie sollten überprüfen, was R als Umgebung, indem:

    Sys.getenv("JAVA_HOME")

    und dann Sie können verwenden, dass die Umwelt durch die Schaffung einer java.conf Datei on /etc/ld.so.conf.d/ wie bereits in der obigen Antwort link.

    InformationsquelleAutor der Antwort lapisdecor

  3. 7

    lösen können Sie dieses problem durch die Eröffnung von rstudio in super-user-wie

    sudo rstudio

    dann innerhalb von R ausgeführt

    install.packages('rJava')

    InformationsquelleAutor der Antwort sagarambat

  4. 5

    wenn Sie mit oracle java verwenden Sie dann folgenden Befehl ein :

    sudo R CMD javareconf

    nicht helfen verwenden: 

    sudo R CMD javareconf **JAVA_HOME**=(path where java home is located)

    InformationsquelleAutor der Antwort sourav karwa

  5. 0

    Ich viele Dinge versucht aber hat nicht geklappt. Dann habe ich versucht, mit 

    sudo rstudio

    dann

    install.packages('rJava')

    Seine Arbeit. Coool

    InformationsquelleAutor der Antwort Ajay Jadhav

Schreibe einen Kommentar