Tag: hdf5

Gibt es eine Möglichkeit, Lesen Sie im HDF5-Dateien mit der Scala-version von Spark? Es sieht aus wie es getan werden kann in Python (über Pyspark), aber ich kann nichts finden für Scala. Dies könnte Ihnen helfen, loszulegen.

Bin ich habe Probleme beim speichern ein numpy csr_matrix mit PyTables. Ich bin immer diese Fehlermeldung: TypeError: objects of type ``csr_matrix`` are not supported in this context, sorry; supported objects are: NumPy array, record or scalar; homogeneous

Brauche ich zum speichern einer 512^3-array auf der Festplatte in irgendeiner Weise und ich bin derzeit mit im HDF5. Da das array spärliche viel Speicherplatz verschwendet. Nicht im HDF5 bieten keine Unterstützung für sparse-array ? [Die Antwort][1]

Ich bin mit dem IM HDF5 C++ - API zu schreiben 2D-array dataset-Dateien. Der HDF-Gruppe hat ein Beispiel zum erstellen eine im HDF5-Datei aus einem statisch definierten array-Größe, die ich modifiziert habe, um die suite meine Bedürfnisse

Ich bin auf der Suche nach einem Beispielcode, die konvertieren kann .h5-Dateien in csv-oder tsv. Ich gelesen zu haben .h5 und Ausgang auf csv-oder tsv. Beispiel-code wäre sehr geschätzt werden,bitte helfen, wie muss ich stecken, es für

In unserem Labor-wir speichern unsere Daten in hdf5 Dateien, die durch das python-Paket h5py. Am Anfang ein experiment erstellen wir ein hdf5 Datei-und Speicher-array nach array von array von Daten in der Datei (unter anderem). Wenn ein

Ich habe eine Datei in hdf5 - format. Ich weiß, dass es sein soll, eine matrix, aber ich will, zu Lesen, dass die matrix in R so dass ich studieren kann. Ich sehe, dass es eine h5r

Lese ich eine csv-Beispieldatei und speichern Sie es auf .h5-Datenbank. Die .csv ist wie folgt aufgebaut: User_ID;Longitude;Latitude;Year;Month;String 267261661;-3.86580025;40.32170825;2013;12;hello world 171255468;-3.83879575;40.05035005;2013;12;hello world 343588169;-3.70759531;40.4055946;2014;2;hello world 908779052;-3.8356385;40.1249459;2013;8;hello world 289540518;-3.6723114;40.3801642;2013;11;hello world 635876313;-3.8323166;40.3379393;2012;10;hello world 175160914;-3.53687933;40.35101274;2013;12;hello world 155029860;-3.68555076;40.47688417;2013;11;hello world Ich habe legt es

Habe ich ein cell-array in matlab columns = {'MagX', 'MagY', 'MagZ', ... 'AccelerationX', 'AccelerationX', 'AccelerationX', ... 'AngularRateX', 'AngularRateX', 'AngularRateX', ... 'Temperature'} Benutze ich diese Skripte die Verwendung von matlab ' s hdf5write-Funktion zum speichern der array in

Ich bin auf der Suche nach einer Möglichkeit zum Anhängen von Daten an eine vorhandene dataset innerhalb einer h5-Datei mit python (h5py). Einem kurzen intro zu meinem Projekt: ich versuche zu trainieren, ein CNN mit medizinischen Bilddaten.

Ich habe eine Frage, wie am besten zu schreiben, im HDF5-Dateien mit python /h5py. Habe ich Daten wie: ----------------------------------------- | timepoint | voltage1 | voltage2 | ... ----------------------------------------- | 178 | 10 | 12 | ... -----------------------------------------

Problem Beschreibung: Ich benutze python pandas zu Lesen, ein paar große CSV-Datei und speichern Sie es in im HDF5-Datei, ist die resultierende im HDF5-Datei ist über 10GB. Das problem tritt auf, wenn die Lektüre es zurück. Obwohl

In python2.7 kann ich analysieren hdf5 Dateien, die Schlüssel verwenden $ python >>> import h5py >>> f = h5py.File('example.h5', 'r') >>> f.keys() [u'some_key'] Jedoch in python3.4, bekomme ich etwas anderes: $ python3 -q >>> import h5py >>>

Ich habe vor kurzem installiert die im HDF5 Bibliothek auf einem ubuntu-Rechner, und bin jetzt Probleme mit Verlinkung zu den exportierten Funktionen. Ich schrieb ein einfaches test-Skript readHDF.cpp zu erklären, die Frage: #include <hdf5.h> int main(int argc,

Ich bin versucht, zu schreiben eine matlab-mex-Funktion, die verwendet libhdf5; Meine Linux-Installation bietet libhdf5-1.8 shared-libraries und-Header. Aber meine version von Matlab r2007b, bietet eine libhdf5.so aus der 1.6 Version. (Matlab .mat Dateien bootstrap im HDF5, offenbar). Wenn

Gibt es eine Möglichkeit zu entfernen, ein dataset aus einer im HDF5-Datei, vorzugsweise mit h5py? Oder alternativ, ist es möglich, zu überschreiben Datensatz, während die anderen Datensätze intakt? Meinem Verständnis, h5py Lesen/schreiben im HDF5-Dateien in 5 Modi

Mithilfe Von Python Ist3, Pandas 0.12 Ich versuche zu schreiben, mehrere csv-Dateien (Gesamtgröße ist 7,9 GB) auf eine im HDF5 speichern, um später zu verarbeiten ab. Die csv-Dateien enthalten rund eine million Zeilen jeweils 15 Spalten und

import pandas as pd dfs = pd.HDFStore('xxxxx.h5') wirft diesen Fehler: "ImportError: HDFStore requires PyTables, "No module named tables" problem importing" Habe ich versucht zu installieren PyTables, die Erfordert Cython. Ich habe Cython 0.21 installiert, aber es wirft

HDFVIEW ist ziemlich gut, aber gibt es alternativen? Wäre es toll, in der Lage, Dinge zu ändern, wie chunking - /Kompressions-Einstellungen - hdfview nicht, dass die Funktionalität - die zimmerreserviereung, ohne das resort laden der Dateien mittels

Ich habe mit pandas-Forschung nun für etwa zwei Monate mit großer Wirkung. Mit einer großen Anzahl von mittelständischen trace-Ereignis-Datensätze, die pandas + PyTables (die im HDF5-interface) stellt eine enorme Aufgabe, die mir erlaubt, zu verarbeiten, heterogene Daten

Habe ich eine Reihe von im HDF5-Dateien, von denen jede ein einzelnes dataset. Die Datensätze sind zu groß, um zu halten Sie in RAM. Ich möchte kombinieren Sie diese Dateien in eine einzelne Datei, die alle Datensätze

Mit HDF5DotNetjemand kann mir bei Beispiel-code, welcher eine im HDF5-Datei, extrahieren Sie den Inhalt eines datasets, und drucken Sie den Inhalt auf der standard-Ausgabe? Bisher habe ich die folgenden: H5.Open(); var h5 = H5F.open("example.h5", H5F.OpenMode.ACC_RDONLY); var dataset

Arbeite ich an einer open-source-Projekt Umgang mit dem hinzufügen von Metadaten zu Ordnern. Die mitgelieferten (Python) API ermöglicht das durchsuchen und die Metadaten zugreifen, wie es war nur ein weiterer Ordner. Denn es ist nur ein weiterer

Jemand da draußen haben genug Erfahrung, w/NetCDF und im HDF5 zu geben, einige Pluspunkte /Minuspunkte über Sie als eine Möglichkeit der Speicherung von wissenschaftlichen Daten? Ich habe im HDF5 und möchte Lesen/schreiben über Java, aber das interface

Ich habe eine Datei in hdf5 - format. Ich weiß, dass es sein soll, eine matrix, aber ich will, zu Lesen, dass die matrix in R so dass ich studieren kann. Ich sehe, dass es eine h5r